More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8242 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  100 
 
 		 468 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  53.65 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  50.94 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  47.99 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  40 
 
 		 492 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  35 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  32.57 
 
 		 515 aa  196  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  34.5 
 
 		 526 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  38.23 
 
 		 492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  34.81 
 
 		 526 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  32.65 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  38.41 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  37.58 
 
 		 492 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  37.58 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  37.58 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  32.98 
 
 		 536 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.88 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  30.82 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  36.34 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.5 
 
 		 530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.29 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  33.41 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.38 
 
 		 514 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  35.33 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  35.11 
 
 		 478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  33.11 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.66 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  34.14 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  31.59 
 
 		 503 aa  163  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  33.54 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  33.67 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  33.89 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  35.83 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  37.47 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.22 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  32.65 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  31.81 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.01 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.19 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.55 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  35.99 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  29.96 
 
 		 486 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  32.15 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  33.11 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  32.27 
 
 		 482 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  34.38 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.25 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  31.66 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.56 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  31.36 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  31.93 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  31.6 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  31.93 
 
 		 484 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  32.78 
 
 		 496 aa  150  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  35.24 
 
 		 481 aa  150  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.36 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  31.14 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.83 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  32.45 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  31.07 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.57 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.02 
 
 		 518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  30.85 
 
 		 496 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  31.36 
 
 		 484 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  26.54 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.97 
 
 		 511 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.13 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  31.39 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.33 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  31.11 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  32.45 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  31.28 
 
 		 487 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  31.29 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  26.44 
 
 		 512 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  31.67 
 
 		 481 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  34.01 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.9 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  30.77 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.9 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.06 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.06 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  32.21 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  32.37 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.41 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  31.82 
 
 		 498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  32.62 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.52 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  30.77 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  30.77 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  32.3 
 
 		 490 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  30.85 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  32.3 
 
 		 490 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  30.77 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  30.77 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  31.44 
 
 		 508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.67 
 
 		 511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  30.77 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.67 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.02 
 
 		 502 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  32.08 
 
 		 490 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>