More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2159 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 525 aa  1076    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  56.07 
 
 		 526 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  55.77 
 
 		 523 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  53.58 
 
 		 526 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  54.9 
 
 		 517 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  50 
 
 		 520 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  45.19 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  32.83 
 
 		 519 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  31.17 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  32.02 
 
 		 492 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  34.16 
 
 		 489 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  32.82 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  32.65 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  32.65 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  31.21 
 
 		 504 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  31.17 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  30.04 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.44 
 
 		 509 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4595  carbohydrate kinase, FGGY  31.53 
 
 		 496 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  26.59 
 
 		 509 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.2 
 
 		 509 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27.85 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  28.46 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  28.93 
 
 		 509 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  26.47 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  26.68 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.71 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.27 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.67 
 
 		 518 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  29.2 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  29.9 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  26.52 
 
 		 511 aa  150  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  28.68 
 
 		 503 aa  150  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.66 
 
 		 488 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.56 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  26.87 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.6 
 
 		 514 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  28.35 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  30.43 
 
 		 486 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  28.35 
 
 		 517 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.49 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  26.81 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.83 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.41 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.83 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.15 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  28.28 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.23 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.61 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  28.96 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.48 
 
 		 500 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.52 
 
 		 530 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  28.6 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.82 
 
 		 508 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  27.88 
 
 		 487 aa  140  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  30.72 
 
 		 499 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  27.83 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.94 
 
 		 496 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  26.17 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  29.66 
 
 		 511 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.24 
 
 		 503 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  26.85 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.58 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  29.92 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  29.92 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.79 
 
 		 538 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  29.92 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.58 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.13 
 
 		 548 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  25.35 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  29.59 
 
 		 503 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  30.13 
 
 		 492 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  28.16 
 
 		 484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  26.14 
 
 		 503 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  26.2 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  23.66 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.4 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  28.03 
 
 		 486 aa  131  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.63 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  28.27 
 
 		 505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  23.47 
 
 		 513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.57 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  27.91 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  27.8 
 
 		 484 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.87 
 
 		 510 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  27.09 
 
 		 485 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  26.72 
 
 		 484 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  29.78 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.13 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.5 
 
 		 500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.86 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.29 
 
 		 509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  27.17 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  29.62 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  23.86 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.86 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  27.13 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  29.19 
 
 		 508 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.17 
 
 		 498 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.17 
 
 		 498 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>