More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2016 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 536 aa  1058    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  47.7 
 
 		 526 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  46.36 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  45.19 
 
 		 525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  44.79 
 
 		 526 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  46.02 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  48.45 
 
 		 520 aa  382  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  32.89 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  34.97 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  37.06 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  31.56 
 
 		 515 aa  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  33.46 
 
 		 484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  33.46 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  32.69 
 
 		 509 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  31.42 
 
 		 504 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4595  carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 		 496 aa  178  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  32.74 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  29.25 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.63 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.82 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.53 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  32.27 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.38 
 
 		 498 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.02 
 
 		 511 aa  146  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  26.89 
 
 		 505 aa  145  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  32.49 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  32.49 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  31.99 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.02 
 
 		 500 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  32.78 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  29.78 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  24.57 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  27.71 
 
 		 502 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.24 
 
 		 503 aa  140  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  27.1 
 
 		 493 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.94 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  28.36 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  30.43 
 
 		 486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.76 
 
 		 504 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.45 
 
 		 496 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  31.67 
 
 		 492 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  29.39 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.39 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  29.39 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.61 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  27.67 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.36 
 
 		 509 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  28.52 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  29.2 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  27.69 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  31.98 
 
 		 492 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  29.72 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.76 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.86 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.14 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  31.25 
 
 		 503 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  28.21 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.33 
 
 		 497 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  23.82 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.99 
 
 		 510 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  25.2 
 
 		 498 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.32 
 
 		 518 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  25.78 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  25.78 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  25.78 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  25 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  25.78 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  25.78 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.89 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.66 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.89 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.13 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  23.18 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  25.48 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.57 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  25.58 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.57 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  25.44 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  27.52 
 
 		 532 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.7 
 
 		 506 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.04 
 
 		 506 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  30.21 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  30.02 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.75 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  25.05 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.85 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  25 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  30.02 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  28.93 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.82 
 
 		 548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  30.02 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  30.02 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  30.02 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  27.98 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  29.82 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  28.9 
 
 		 494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  29.96 
 
 		 484 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  28.03 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  28.76 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  29.95 
 
 		 540 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>