More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4595 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4595  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 496 aa  966    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 		 536 aa  174  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  31.74 
 
 		 520 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  31.66 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  31.03 
 
 		 525 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  31.98 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  30.21 
 
 		 517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  29.58 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  30.79 
 
 		 484 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  28.24 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  30.32 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.38 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  27.95 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  31.75 
 
 		 492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  32.3 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  27.54 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.62 
 
 		 509 aa  113  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  30.83 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  22.88 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  26.46 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  30.33 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.19 
 
 		 548 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  22.71 
 
 		 502 aa  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  26.17 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  24.28 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.11 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  29.78 
 
 		 482 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  30.74 
 
 		 501 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.13 
 
 		 505 aa  97.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  25.29 
 
 		 519 aa  97.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.42 
 
 		 511 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.47 
 
 		 512 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  27.97 
 
 		 517 aa  94.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  22.14 
 
 		 505 aa  93.6  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  27.97 
 
 		 517 aa  93.6  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.1 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  27.51 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.76 
 
 		 495 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  27.31 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  26.27 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  27.5 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.1 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  25.48 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  27.11 
 
 		 498 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.94 
 
 		 498 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.47 
 
 		 530 aa  90.1  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  25.59 
 
 		 509 aa  90.1  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  28.95 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  27.11 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.55 
 
 		 518 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  27.11 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.52 
 
 		 524 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  21.59 
 
 		 517 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  21.59 
 
 		 517 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  29.27 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  26.27 
 
 		 495 aa  86.7  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  28.57 
 
 		 540 aa  87  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  24.2 
 
 		 496 aa  86.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  31.19 
 
 		 499 aa  86.7  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  30.95 
 
 		 494 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  30.95 
 
 		 494 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.73 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  27.31 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  28.96 
 
 		 501 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  25.24 
 
 		 528 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  23.91 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.8 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  29.2 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.66 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0150  gluconate kinase  27.27 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.731797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  23.68 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  26.17 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  23.43 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  23.68 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.31 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  27.46 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.1 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.15 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  27.54 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  29.67 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  26.71 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  26.56 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  28.11 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  26.56 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  22.54 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  28.03 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  26.26 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  26.5 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  27.9 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  28.73 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  29.37 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  28.97 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  25.49 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  27.78 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  28.54 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  22.4 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  26.33 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  26.33 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  31.01 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>