More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 		 492 aa  972    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  42.86 
 
 		 489 aa  297  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  35.13 
 
 		 519 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  37.8 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  38.9 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  42.65 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  35.95 
 
 		 536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  33.82 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.92 
 
 		 496 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.27 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.74 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  32.42 
 
 		 525 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  33.14 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  33.55 
 
 		 526 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.16 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  35.86 
 
 		 481 aa  202  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.4 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.48 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  30.24 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.84 
 
 		 498 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  30.24 
 
 		 498 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.73 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  29.84 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  29.84 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.84 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.64 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  29.84 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  29.84 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  29.84 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.86 
 
 		 509 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.84 
 
 		 498 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.64 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  29.92 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.78 
 
 		 509 aa  192  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.48 
 
 		 512 aa  189  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.28 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.13 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  30.78 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  28.51 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.35 
 
 		 490 aa  183  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  34.06 
 
 		 472 aa  183  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  28.49 
 
 		 502 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.36 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  32.54 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  28.72 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.46 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  30.65 
 
 		 526 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.35 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.67 
 
 		 510 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  34.02 
 
 		 484 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  31.29 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.41 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  31.29 
 
 		 484 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  32.07 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  31.76 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  30.12 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  32.72 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  30.4 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  31.08 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  28.11 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  32.47 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  30.51 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  31.76 
 
 		 517 aa  177  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.4 
 
 		 511 aa  177  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  29.82 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  30.52 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  29.06 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  34.22 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  32.27 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  30.88 
 
 		 484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  30.72 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  29.51 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.26 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  28.11 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.96 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.01 
 
 		 495 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  30.31 
 
 		 484 aa  173  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.1 
 
 		 512 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  31.75 
 
 		 486 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.19 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  26.54 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.19 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  31.9 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.03 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.73 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.11 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  31.82 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  30.67 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  29.13 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.77 
 
 		 514 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.6 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  30.47 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.15 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  30.27 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  30.47 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  30.47 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  30.47 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  27.54 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  31.33 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  30.47 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>