More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2571 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
520 aa  1025    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  50 
 
 
525 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  48.15 
 
 
526 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  48.45 
 
 
536 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  43.22 
 
 
526 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  44.64 
 
 
523 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  44.83 
 
 
517 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  34.05 
 
 
519 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  34.32 
 
 
492 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  34.48 
 
 
489 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  30.08 
 
 
515 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  34.29 
 
 
484 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  32.06 
 
 
509 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  30.56 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4595  carbohydrate kinase, FGGY  31.74 
 
 
496 aa  173  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  32.27 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  35.31 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  28.29 
 
 
503 aa  161  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  31.16 
 
 
511 aa  160  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.48 
 
 
509 aa  154  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  28.82 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.06 
 
 
509 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.72 
 
 
509 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  25.76 
 
 
509 aa  147  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.06 
 
 
512 aa  146  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.68 
 
 
506 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  24.32 
 
 
502 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  25.56 
 
 
499 aa  143  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  27.15 
 
 
512 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.29 
 
 
503 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  29.1 
 
 
519 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.6 
 
 
496 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.1 
 
 
504 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  28 
 
 
511 aa  137  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  27.79 
 
 
495 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.76 
 
 
509 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  26.24 
 
 
509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.85 
 
 
496 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.29 
 
 
498 aa  133  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.32 
 
 
481 aa  133  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  30.51 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  29.61 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  30.63 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  26.09 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.95 
 
 
503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.64 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  29.79 
 
 
472 aa  127  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  29.41 
 
 
484 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  28.08 
 
 
506 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  29.51 
 
 
503 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.13 
 
 
484 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  30.7 
 
 
486 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.34 
 
 
518 aa  126  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.43 
 
 
499 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.11 
 
 
511 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.8 
 
 
500 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  28.22 
 
 
517 aa  124  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  28.22 
 
 
517 aa  123  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  22.75 
 
 
512 aa  123  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.16 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  29.22 
 
 
484 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  23.71 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  28.52 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  28.52 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  30.42 
 
 
504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  23.9 
 
 
512 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.1 
 
 
498 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  22.24 
 
 
505 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.3 
 
 
498 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  28.32 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.1 
 
 
498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.9 
 
 
498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  28.42 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  28.6 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  28.69 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  32.22 
 
 
503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.09 
 
 
548 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.95 
 
 
498 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  27.74 
 
 
486 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  25.92 
 
 
486 aa  120  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.53 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.25 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.05 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  28.21 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.95 
 
 
538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  30.9 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  29.77 
 
 
492 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  31.18 
 
 
492 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  31.18 
 
 
492 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  31.18 
 
 
492 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  30.97 
 
 
478 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  28.87 
 
 
503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  28.02 
 
 
493 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  29.45 
 
 
493 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  30.75 
 
 
492 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  26.65 
 
 
509 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  30.66 
 
 
478 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.31 
 
 
506 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  28.79 
 
 
490 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>