More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3522 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  88.15 
 
 		 503 aa  882    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 504 aa  1011    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  50.61 
 
 		 491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3247  carbohydrate kinase  47.6 
 
 		 495 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3381  carbohydrate kinase FGGY  47.4 
 
 		 495 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  46.08 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0907  glycerol kinase  46.64 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  42.97 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  39.39 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  41.35 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  41.15 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  39.19 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  41.35 
 
 		 499 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  39.36 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  41.58 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  40.4 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  41.12 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  40.32 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2442  carbohydrate kinase, FGGY  37.45 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0259159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  40.67 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  42.45 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  39.76 
 
 		 502 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  40.28 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  42.45 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  40.28 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  42.45 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  40.68 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  42.45 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  39 
 
 		 495 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  39.76 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  42 
 
 		 498 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  40.28 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  39.53 
 
 		 499 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  40.28 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  39.72 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  38.83 
 
 		 494 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  37.9 
 
 		 501 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  39.57 
 
 		 500 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  37.93 
 
 		 489 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  40.48 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  42.01 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  38.95 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  40.08 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  38.15 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  38.76 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  41.79 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  40.88 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  38.96 
 
 		 493 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  41.79 
 
 		 500 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  39.61 
 
 		 502 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  40.56 
 
 		 505 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  39.56 
 
 		 501 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  40.59 
 
 		 501 aa  359  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  39.53 
 
 		 502 aa  359  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  37.88 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  38.97 
 
 		 505 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  42.63 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  39.33 
 
 		 502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  39.33 
 
 		 502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  37.55 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  39.33 
 
 		 502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  39.19 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  40.12 
 
 		 505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  39.33 
 
 		 502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  39.56 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  43.03 
 
 		 496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  39.09 
 
 		 509 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  42.64 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  37.8 
 
 		 494 aa  355  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  40.87 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  39.72 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  39.72 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  39.72 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  39.41 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  38.68 
 
 		 507 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  37.2 
 
 		 494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  39.6 
 
 		 503 aa  352  8e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  37.37 
 
 		 501 aa  351  1e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  36.03 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  38.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  35.93 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  40.16 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  35.93 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  39.52 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  43.98 
 
 		 495 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  38.41 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2253  carbohydrate kinase FGGY  42.42 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  38.6 
 
 		 495 aa  350  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  38.46 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  37.45 
 
 		 502 aa  350  5e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  41.12 
 
 		 495 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  39.88 
 
 		 505 aa  350  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  35.73 
 
 		 496 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>