More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2645 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3247  carbohydrate kinase  69.9 
 
 
495 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3381  carbohydrate kinase FGGY  70.3 
 
 
495 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0907  glycerol kinase  69.43 
 
 
480 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 
496 aa  1011    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  51.74 
 
 
491 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  46.08 
 
 
504 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  45.67 
 
 
503 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  41.84 
 
 
496 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  42.04 
 
 
496 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2031  carbohydrate kinase FGGY  44.49 
 
 
488 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0853026  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  44.2 
 
 
502 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2253  carbohydrate kinase FGGY  44.17 
 
 
488 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3130  carbohydrate kinase FGGY  42.28 
 
 
489 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  39.71 
 
 
496 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  39.84 
 
 
500 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  43.2 
 
 
505 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  43.51 
 
 
513 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  42.11 
 
 
496 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  41.79 
 
 
505 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  40.32 
 
 
500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  41.05 
 
 
503 aa  362  9e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  41.75 
 
 
496 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  41.05 
 
 
501 aa  362  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  40.12 
 
 
500 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  39.92 
 
 
500 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  39.92 
 
 
500 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  39.92 
 
 
500 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  39.92 
 
 
500 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  40.12 
 
 
498 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  42.2 
 
 
498 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  39.72 
 
 
505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  40 
 
 
489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  38.7 
 
 
496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  38.7 
 
 
496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  42.77 
 
 
496 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  40 
 
 
498 aa  355  6.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  38.49 
 
 
496 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  38.49 
 
 
496 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  41.09 
 
 
520 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  38.49 
 
 
496 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  39.39 
 
 
497 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  38.49 
 
 
496 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  38.29 
 
 
496 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  38.9 
 
 
496 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  40.4 
 
 
496 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  40.04 
 
 
509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  38.29 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  38.89 
 
 
479 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  41.82 
 
 
499 aa  353  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  39.72 
 
 
503 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  39.72 
 
 
503 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  39.31 
 
 
499 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  39.72 
 
 
518 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  39.72 
 
 
518 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  39.72 
 
 
518 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  39.72 
 
 
518 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  39.72 
 
 
518 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  41.07 
 
 
496 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  39.52 
 
 
500 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  39.51 
 
 
501 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  41.56 
 
 
499 aa  349  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  40.04 
 
 
510 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  39.31 
 
 
501 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  39.14 
 
 
498 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  40 
 
 
496 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  40.89 
 
 
496 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  39.14 
 
 
498 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  41.26 
 
 
501 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  39.11 
 
 
499 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  38.99 
 
 
501 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  40.72 
 
 
504 aa  347  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  37.45 
 
 
494 aa  347  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  39.39 
 
 
497 aa  346  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  40.33 
 
 
516 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  37.8 
 
 
507 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1657  glycerol kinase  39.31 
 
 
510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  40.89 
 
 
497 aa  343  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  38.99 
 
 
502 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  40.69 
 
 
500 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  38.59 
 
 
497 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  38.71 
 
 
493 aa  342  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  40.12 
 
 
501 aa  342  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  39.1 
 
 
499 aa  342  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  39.56 
 
 
502 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  37.83 
 
 
498 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  39.56 
 
 
502 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  39.56 
 
 
502 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  39.47 
 
 
502 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  39.56 
 
 
502 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  41.43 
 
 
507 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  39.56 
 
 
502 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  39.16 
 
 
503 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1485  glycerol kinase  36.86 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00136931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  43.6 
 
 
495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  39.72 
 
 
503 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  38.91 
 
 
501 aa  340  4e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  38.4 
 
 
502 aa  339  5e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  38.8 
 
 
498 aa  340  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  40.4 
 
 
501 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  39.16 
 
 
502 aa  339  7e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>