More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2403 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  100 
 
 		 491 aa  990    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3247  carbohydrate kinase  52.66 
 
 		 495 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3381  carbohydrate kinase FGGY  52.87 
 
 		 495 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  51.74 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0907  glycerol kinase  52.03 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  50.61 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  49.7 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  42.45 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3130  carbohydrate kinase FGGY  47.3 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  42.04 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2031  carbohydrate kinase FGGY  46.68 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0853026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  42.94 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  44.92 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  43.93 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  43.35 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  40.7 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2253  carbohydrate kinase FGGY  45.23 
 
 		 488 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  44.83 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  41.9 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  43.27 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  41.53 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  40.53 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  38.98 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  41.87 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  38.98 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  38.98 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  38.98 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  42.14 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2805  carbohydrate kinase FGGY  42.89 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  46.23 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  41.13 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  43.89 
 
 		 520 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  38.78 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  38.78 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  44.13 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  41.85 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  38.78 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  43.29 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  41.65 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  38.78 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  44.9 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  44.85 
 
 		 498 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  44.44 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  44.67 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  41.08 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  43.67 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  38.57 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  41.5 
 
 		 498 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  39.84 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  43.86 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  42.91 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  40.73 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  39.8 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  41.08 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  43.06 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  41.08 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  41.44 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  42.74 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  43.12 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  41.94 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  41.06 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  43.44 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  40.57 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  42.35 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  43.44 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  42.74 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  39.39 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  43.44 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  43.44 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  40.61 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  45.19 
 
 		 495 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  41.26 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  42.54 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  42.13 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  44.6 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  39.48 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  42.18 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  41.48 
 
 		 489 aa  382  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  40.85 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  42.51 
 
 		 505 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  40.56 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  40.56 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  41.48 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  43.29 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  41.18 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  41.18 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  43.67 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  43.24 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  41.48 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  43.24 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  40.56 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  41.18 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  42.54 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  40.56 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  44.62 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  40.56 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  40.16 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  40.16 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  39.18 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  39.18 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>