More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2031 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3130  carbohydrate kinase FGGY  68.34 
 
 
489 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2031  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
488 aa  989    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0853026  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2253  carbohydrate kinase FGGY  89.75 
 
 
488 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  46.68 
 
 
491 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  44.49 
 
 
496 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3247  carbohydrate kinase  42.42 
 
 
495 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3381  carbohydrate kinase FGGY  42.42 
 
 
495 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  39.76 
 
 
496 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  39.76 
 
 
496 aa  362  9e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  42.03 
 
 
483 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  38.89 
 
 
479 aa  352  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0907  glycerol kinase  41.31 
 
 
480 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  40.04 
 
 
489 aa  349  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  42.3 
 
 
504 aa  349  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  40.24 
 
 
496 aa  349  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  42.08 
 
 
503 aa  345  7e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  38.87 
 
 
503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  41.15 
 
 
483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  39.71 
 
 
507 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  39.43 
 
 
492 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  42.2 
 
 
500 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  40.76 
 
 
503 aa  342  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0962  glycerol kinase  38.92 
 
 
483 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  39.43 
 
 
492 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  42.2 
 
 
500 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1940  glycerol kinase  40.82 
 
 
483 aa  342  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  39.22 
 
 
492 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  41.98 
 
 
500 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  38.17 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  40.17 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  38.17 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  42.2 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  42.2 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  42.2 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  39.47 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  38.38 
 
 
496 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  38.38 
 
 
496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  38.17 
 
 
496 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  38.17 
 
 
496 aa  339  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  42.2 
 
 
505 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  38.17 
 
 
496 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  37.96 
 
 
496 aa  338  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  38.17 
 
 
496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  40.45 
 
 
498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  40.66 
 
 
493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  39.18 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  37.58 
 
 
496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  38.52 
 
 
494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2442  carbohydrate kinase, FGGY  37.76 
 
 
494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0259159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  38.74 
 
 
501 aa  336  5e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  39 
 
 
510 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  38.01 
 
 
497 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  39.92 
 
 
503 aa  335  7.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  39.88 
 
 
496 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  39.34 
 
 
502 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  40.53 
 
 
499 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  40.62 
 
 
499 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  36.94 
 
 
494 aa  333  5e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  38.21 
 
 
501 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  40.28 
 
 
498 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  38.37 
 
 
498 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  39.88 
 
 
501 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  41.28 
 
 
503 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  41.28 
 
 
503 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  38.01 
 
 
500 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  41.28 
 
 
518 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  41.28 
 
 
518 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  41.28 
 
 
518 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  41.28 
 
 
518 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  41.28 
 
 
518 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  41.34 
 
 
496 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  42.04 
 
 
496 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  38.01 
 
 
500 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  37.5 
 
 
494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  36.61 
 
 
499 aa  330  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  39.59 
 
 
495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  39.71 
 
 
501 aa  329  7e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  40.84 
 
 
500 aa  329  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  42.23 
 
 
502 aa  329  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  37.01 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  40.21 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  39.36 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  39.92 
 
 
520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  38.85 
 
 
498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  39.68 
 
 
498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1325  glycerol kinase  43.38 
 
 
484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.0494586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  40.49 
 
 
498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  37.39 
 
 
502 aa  327  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  41.14 
 
 
505 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  41.77 
 
 
488 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  39.72 
 
 
500 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  38.48 
 
 
513 aa  326  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2805  carbohydrate kinase FGGY  35.98 
 
 
493 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  42.45 
 
 
507 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  37.3 
 
 
499 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  39.44 
 
 
505 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2082  glycerol kinase  41.72 
 
 
497 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  40.61 
 
 
500 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  42.99 
 
 
497 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  39.6 
 
 
516 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>