More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5747 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  100 
 
 
488 aa  959    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1325  glycerol kinase  64.03 
 
 
484 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.0494586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3101  glycerol kinase  58.33 
 
 
493 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  53.04 
 
 
503 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  57.05 
 
 
496 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  56.42 
 
 
496 aa  498  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  52.64 
 
 
520 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  50.21 
 
 
496 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  50.62 
 
 
496 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  49.59 
 
 
501 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  49.48 
 
 
499 aa  480  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  49.39 
 
 
500 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  49.39 
 
 
500 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  49.59 
 
 
500 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  49.39 
 
 
500 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  52.86 
 
 
496 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  50.2 
 
 
500 aa  477  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  49.49 
 
 
500 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  49.39 
 
 
500 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  48.68 
 
 
505 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  53.27 
 
 
496 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  50.64 
 
 
498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  53.59 
 
 
492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  51.43 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  48.37 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  46.45 
 
 
499 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  45.93 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  53.39 
 
 
492 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  46.25 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  45.93 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  46.76 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  51.81 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  45.93 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  52.35 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  45.93 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  45.73 
 
 
496 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  46.76 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  52.14 
 
 
498 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  45.73 
 
 
496 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  45.73 
 
 
496 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  45.73 
 
 
496 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  45.73 
 
 
496 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  53.09 
 
 
495 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  45.53 
 
 
496 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  47.35 
 
 
489 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  45.79 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  52.87 
 
 
492 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1657  glycerol kinase  52.57 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  47.56 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  50.62 
 
 
495 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  48.07 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  50.82 
 
 
498 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  44.31 
 
 
502 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  53.16 
 
 
502 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  51.43 
 
 
497 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  50.41 
 
 
497 aa  456  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  52.88 
 
 
492 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  48.29 
 
 
503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  48.29 
 
 
503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  48.29 
 
 
518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  47.35 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  48.98 
 
 
499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  45.33 
 
 
497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  48.29 
 
 
518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2082  glycerol kinase  51.52 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  44.83 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  48.29 
 
 
518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  48.29 
 
 
518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  48.77 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  48.29 
 
 
518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  46.34 
 
 
496 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  51.63 
 
 
498 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  46.94 
 
 
510 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  46.75 
 
 
503 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  52.34 
 
 
498 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  45.01 
 
 
500 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  45.44 
 
 
498 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  47.6 
 
 
501 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  46.4 
 
 
510 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  47.12 
 
 
494 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  51.43 
 
 
498 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  49.39 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  43.72 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  47.06 
 
 
496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  49.39 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  47.47 
 
 
499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  49.39 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  47.74 
 
 
509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08090  glycerol kinase  46.31 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000058898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  52.54 
 
 
497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  46.84 
 
 
493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  50.81 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  46.68 
 
 
495 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  46.64 
 
 
494 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  47.55 
 
 
500 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  48.26 
 
 
501 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  49.9 
 
 
497 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  47.49 
 
 
504 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  46.71 
 
 
502 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1485  glycerol kinase  44.92 
 
 
505 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00136931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>