More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3101 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3101  glycerol kinase  100 
 
 		 493 aa  983    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1325  glycerol kinase  67.62 
 
 		 484 aa  651    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.0494586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  58.13 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  52.23 
 
 		 520 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  52.43 
 
 		 496 aa  498  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  53.64 
 
 		 497 aa  501  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  51.42 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  50.3 
 
 		 501 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  49.6 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  48.78 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  48.78 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  48.28 
 
 		 501 aa  485  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  48.58 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  50.3 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  47.77 
 
 		 498 aa  481  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  52.45 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  51.12 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  50.71 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  51.01 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  52.65 
 
 		 492 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  50.71 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  52.83 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  52.45 
 
 		 492 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  50.1 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  50.71 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  46.15 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  49.18 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  49.19 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  49.39 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  48.91 
 
 		 510 aa  473  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  46.12 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  51.32 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  48.32 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  49.8 
 
 		 497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1188  glycerol kinase  48.99 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  48.78 
 
 		 509 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  49.39 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  45.73 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  46 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  49.09 
 
 		 497 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  48.58 
 
 		 500 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  47.98 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  50 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  49.29 
 
 		 501 aa  465  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  47.98 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  47.72 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  48.58 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  47.98 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  46.2 
 
 		 498 aa  461  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  46.86 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  48.38 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  48.38 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1215  glycerol kinase  47.98 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  48.58 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  48.38 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  48.38 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  46.2 
 
 		 498 aa  461  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  50 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  45.51 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  50.81 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  46.56 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  46.36 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  45.51 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  48.99 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  51 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  46.56 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1128  glycerol kinase  48.53 
 
 		 523 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  46.56 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  48.18 
 
 		 503 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  48.18 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  48.18 
 
 		 503 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  48.18 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  46.56 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  47.98 
 
 		 500 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  47.77 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  46.15 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  48.18 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  44.94 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  47.57 
 
 		 499 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  47.37 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  48.17 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  46.15 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  48.18 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  48.18 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>