More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0291 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  100 
 
 
496 aa  995    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  61.13 
 
 
492 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  61.13 
 
 
492 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  60.93 
 
 
492 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  59.51 
 
 
492 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  55.15 
 
 
505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  55.15 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  54.95 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  54.55 
 
 
500 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  54.55 
 
 
500 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  55.15 
 
 
503 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  55.15 
 
 
518 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  55.15 
 
 
503 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  54.95 
 
 
500 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  54.75 
 
 
500 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  54.55 
 
 
500 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  58.7 
 
 
503 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  54.55 
 
 
500 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  54.55 
 
 
500 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  55.15 
 
 
518 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  55.15 
 
 
518 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  55.15 
 
 
518 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  55.15 
 
 
518 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  54.95 
 
 
499 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  57.66 
 
 
496 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.74 
 
 
501 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.72 
 
 
496 aa  546  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  52.41 
 
 
501 aa  543  1e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  52.52 
 
 
496 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  52.93 
 
 
497 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  56.37 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.25 
 
 
494 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.45 
 
 
494 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.05 
 
 
494 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  55.24 
 
 
496 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  51.42 
 
 
496 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  53.43 
 
 
501 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  51.42 
 
 
496 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  54.4 
 
 
520 aa  535  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  51.63 
 
 
496 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  54.25 
 
 
498 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  54.09 
 
 
498 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  52.93 
 
 
503 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  53.64 
 
 
494 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  51.22 
 
 
496 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  51.22 
 
 
496 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  51.22 
 
 
496 aa  531  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  53.85 
 
 
494 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  53.13 
 
 
507 aa  535  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  51.22 
 
 
496 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  51.22 
 
 
496 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  53.44 
 
 
494 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  54.95 
 
 
498 aa  532  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  51.81 
 
 
500 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  51.41 
 
 
500 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  52.53 
 
 
502 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  52.22 
 
 
507 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  53.13 
 
 
507 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  53.13 
 
 
507 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  51.22 
 
 
496 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  53.64 
 
 
494 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  51.72 
 
 
502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.04 
 
 
494 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  51.72 
 
 
502 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  53.69 
 
 
498 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  53.04 
 
 
495 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  53.44 
 
 
494 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  51.72 
 
 
502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  51.72 
 
 
502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  51.72 
 
 
502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  51.92 
 
 
503 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  51.72 
 
 
502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  53.44 
 
 
494 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  50.6 
 
 
494 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  51.72 
 
 
503 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  54.34 
 
 
502 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  52.53 
 
 
503 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  53.74 
 
 
497 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  50.91 
 
 
502 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  53.54 
 
 
497 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  51.11 
 
 
502 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  54.64 
 
 
496 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  51.13 
 
 
510 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  52.53 
 
 
498 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  51.61 
 
 
498 aa  524  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  49.8 
 
 
498 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  52.31 
 
 
497 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  54.03 
 
 
510 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  50.81 
 
 
497 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  52.63 
 
 
499 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  49.8 
 
 
498 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  51.61 
 
 
489 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.23 
 
 
495 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>