More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1325 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3101  glycerol kinase  67.62 
 
 		 493 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1325  glycerol kinase  100 
 
 		 484 aa  963    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.0494586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  64.03 
 
 		 488 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  50.81 
 
 		 496 aa  498  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  52.23 
 
 		 501 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  53.66 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  55.65 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  55.85 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  51.02 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  55.03 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  55.85 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  52.54 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  51.33 
 
 		 500 aa  488  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  53.33 
 
 		 502 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  52.74 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  51.83 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  48.25 
 
 		 498 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  53.25 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  48.25 
 
 		 498 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  52.52 
 
 		 507 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  52.73 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  52.02 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  52.12 
 
 		 498 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  51.42 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  47.02 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  48.88 
 
 		 489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  52.64 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  52.02 
 
 		 519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  51.43 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  52.02 
 
 		 503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  52.86 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  47.64 
 
 		 496 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  54.05 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  47.43 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  47.43 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  47.43 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  47.43 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  50.81 
 
 		 497 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  47.64 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  51.12 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  48.68 
 
 		 498 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  47.43 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  47.36 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  47.43 
 
 		 496 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  53.63 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  52.85 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  49.39 
 
 		 498 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  47.02 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  48.88 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  49.29 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  49.8 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  49.9 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  51.83 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  49.8 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  49.09 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  51.53 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  46.61 
 
 		 496 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  48.68 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  50.2 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  47.84 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  48.68 
 
 		 499 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  50.21 
 
 		 489 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1188  glycerol kinase  47.87 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  51.36 
 
 		 529 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  48.37 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  50.2 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  47.84 
 
 		 514 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  47.84 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  51.93 
 
 		 497 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  47.54 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  49.49 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  50.72 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  50.41 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  48.98 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  51.52 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  49.8 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  49.59 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  50.72 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  51.02 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  48.37 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  48.78 
 
 		 500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  48.78 
 
 		 500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  49.8 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  50.72 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  48.17 
 
 		 500 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  48.78 
 
 		 500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1128  glycerol kinase  51.08 
 
 		 523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  51.61 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  47.02 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1215  glycerol kinase  47.26 
 
 		 500 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4817  glycerol kinase  47.17 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.274509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  50 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  48.48 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  51.42 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  48.17 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  48.25 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  49.28 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  49.19 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  48.56 
 
 		 494 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  49.59 
 
 		 493 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>