More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1657 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2082  glycerol kinase  74.24 
 
 		 497 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1657  glycerol kinase  100 
 
 		 510 aa  1003    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  59.4 
 
 		 503 aa  593  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  55.82 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.83 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  52.43 
 
 		 496 aa  527  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  49.7 
 
 		 498 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  50.1 
 
 		 501 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  52.64 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  51.42 
 
 		 520 aa  512  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  54.23 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  54.64 
 
 		 496 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  48.58 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  47.89 
 
 		 497 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  48.58 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  50.1 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  50.2 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  53.63 
 
 		 502 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  51.87 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  48.06 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  49.8 
 
 		 507 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  46.41 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  49.8 
 
 		 507 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  52.51 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  50 
 
 		 494 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  50 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  49.8 
 
 		 507 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  49.51 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  46.41 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  50.4 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  46.3 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  51.8 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  50.2 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  50.4 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  52.51 
 
 		 510 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  50.4 
 
 		 501 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  46.33 
 
 		 496 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  50.19 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  51.61 
 
 		 507 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  48.98 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  46.33 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  44.65 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  50.2 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  49.61 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  49.21 
 
 		 500 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  48.58 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  49.7 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  50.71 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  48.79 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  48.79 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  48.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  48.98 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  48.79 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  49.39 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  48.79 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  46.12 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  48.98 
 
 		 503 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  46.12 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  46.12 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  45.92 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  49.5 
 
 		 505 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  54.38 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  50 
 
 		 500 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  50 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  54.38 
 
 		 492 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  54.18 
 
 		 492 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  48.29 
 
 		 502 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  50.4 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  48.8 
 
 		 505 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  46.12 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  48.8 
 
 		 503 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  49.9 
 
 		 495 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  49.2 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  50.3 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  45.71 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  45.93 
 
 		 496 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  53.52 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  50.1 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  50.1 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  50.1 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08090  glycerol kinase  47.57 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000058898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  49.9 
 
 		 497 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  49.49 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  49.8 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  50.5 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  50.2 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  52.94 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  50.1 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  50.1 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  50.1 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  52.43 
 
 		 497 aa  482  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  50.1 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>