More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 		 484 aa  969    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  52.08 
 
 		 482 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  50.94 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  47.99 
 
 		 489 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  38.04 
 
 		 492 aa  253  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  33.08 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  31.05 
 
 		 526 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  32.79 
 
 		 525 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  31.19 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  33.79 
 
 		 523 aa  192  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  32.77 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  34.55 
 
 		 526 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  34.17 
 
 		 517 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  33.49 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  32.72 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  28.02 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  29.04 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  28.69 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  31.11 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  33.33 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  33.85 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  32.15 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.08 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.16 
 
 		 499 aa  160  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  30.05 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  32.58 
 
 		 495 aa  156  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.93 
 
 		 501 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  32.92 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.42 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  31.52 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  31.19 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  32.43 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  33.26 
 
 		 506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  34.02 
 
 		 492 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.52 
 
 		 530 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  34.25 
 
 		 492 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  34.25 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  34.25 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  32.52 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  32.49 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  25.34 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  26.49 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.55 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  26.61 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.02 
 
 		 514 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  32.37 
 
 		 478 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  32.72 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  34.4 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  29.61 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  32.37 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  34.13 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  30.38 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  29.7 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  29.7 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  26.1 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.38 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  32.41 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  29.55 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.29 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  27.05 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  29.55 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.58 
 
 		 513 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  27.38 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.26 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  26.97 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  25.39 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.45 
 
 		 515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  30.99 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.95 
 
 		 484 aa  136  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.92 
 
 		 512 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  32.54 
 
 		 508 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.92 
 
 		 511 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.82 
 
 		 548 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.1 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.1 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  27.9 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.51 
 
 		 497 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.74 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  30.59 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.9 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  27.86 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  24.9 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.76 
 
 		 513 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  28.54 
 
 		 503 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.24 
 
 		 513 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.9 
 
 		 513 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  24.9 
 
 		 513 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  30.44 
 
 		 509 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.9 
 
 		 513 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  31.07 
 
 		 474 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.15 
 
 		 518 aa  133  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  27.65 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  31.1 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  31.07 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  31.29 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  31.07 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.03 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  30.75 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  31.47 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>