More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4068 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
482 aa  956    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  52.6 
 
 
484 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  53.86 
 
 
468 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  45.01 
 
 
489 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  38.9 
 
 
492 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  34.53 
 
 
519 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  34.36 
 
 
515 aa  230  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  34.9 
 
 
526 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 
536 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  33.26 
 
 
525 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  33.79 
 
 
526 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  37.32 
 
 
472 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  32.03 
 
 
503 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  34.03 
 
 
472 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  33.94 
 
 
511 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  32.66 
 
 
523 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.79 
 
 
498 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.33 
 
 
509 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.12 
 
 
484 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  32.92 
 
 
481 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  32.12 
 
 
509 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.35 
 
 
518 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  36.46 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  34.35 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  33.06 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  36.53 
 
 
492 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  36.53 
 
 
492 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  30.1 
 
 
495 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  33.53 
 
 
517 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 
506 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  36.33 
 
 
492 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  32.65 
 
 
496 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  32.6 
 
 
493 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  36.33 
 
 
492 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  32.96 
 
 
478 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.03 
 
 
510 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.67 
 
 
493 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  32.19 
 
 
493 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  32.19 
 
 
493 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  31.36 
 
 
494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  31.85 
 
 
520 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  32.27 
 
 
509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  32.85 
 
 
486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.34 
 
 
483 aa  166  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  31.99 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  33.74 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  32.38 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.46 
 
 
488 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  31.59 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.57 
 
 
490 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  32.39 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.13 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  33.6 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  35.58 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  33.18 
 
 
481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  30.86 
 
 
493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  30.33 
 
 
487 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  32.19 
 
 
493 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  33.18 
 
 
478 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  31.83 
 
 
478 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  31 
 
 
496 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.07 
 
 
511 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  29.88 
 
 
481 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33 
 
 
501 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
474 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  30.86 
 
 
485 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  33.65 
 
 
474 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
474 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.51 
 
 
515 aa  160  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  32.11 
 
 
493 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  30.2 
 
 
483 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  31.17 
 
 
492 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  31.86 
 
 
499 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  32.18 
 
 
490 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  30.36 
 
 
484 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  32.18 
 
 
490 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  31.31 
 
 
501 aa  156  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.37 
 
 
530 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.55 
 
 
514 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  31.97 
 
 
490 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  30.33 
 
 
484 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  31.97 
 
 
490 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  31.06 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  32.18 
 
 
477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.98 
 
 
504 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.29 
 
 
538 aa  154  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  30.77 
 
 
484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  31.98 
 
 
483 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  30.64 
 
 
484 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  34.12 
 
 
524 aa  153  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  30.02 
 
 
497 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  25.92 
 
 
484 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  30.71 
 
 
484 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  32.19 
 
 
493 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  32.99 
 
 
485 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  30.14 
 
 
498 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  30.88 
 
 
484 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  32.19 
 
 
493 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  32.19 
 
 
493 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.37 
 
 
492 aa  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>