More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3230 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  100 
 
 		 526 aa  1060    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  56.07 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  52.05 
 
 		 517 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  50.19 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  50.58 
 
 		 523 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  48.08 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  48.15 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  31.07 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  33.02 
 
 		 515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  34.71 
 
 		 482 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  34.44 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  31.69 
 
 		 484 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  32.66 
 
 		 492 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  34.69 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  27.76 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4595  carbohydrate kinase, FGGY  30.68 
 
 		 496 aa  167  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  30.27 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.91 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  29.58 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.44 
 
 		 509 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.16 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.51 
 
 		 509 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.26 
 
 		 506 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  31.2 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.87 
 
 		 499 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  27.22 
 
 		 511 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  24.66 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.39 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.8 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  30.28 
 
 		 501 aa  146  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.72 
 
 		 518 aa  146  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.04 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.32 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  27.1 
 
 		 509 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.11 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.95 
 
 		 502 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.75 
 
 		 487 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  26.93 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  28.51 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  24.85 
 
 		 505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.14 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.75 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  28.51 
 
 		 496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  28.54 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  27.26 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  28.66 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  28.05 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  31.49 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  30.47 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.73 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.41 
 
 		 514 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  25.79 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.9 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  28.51 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.86 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  30.72 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.54 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  29.5 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  25.64 
 
 		 488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  23.33 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  29.65 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.63 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  27.41 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  28.19 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.17 
 
 		 501 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  25.69 
 
 		 515 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  24.45 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  22.87 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.86 
 
 		 496 aa  127  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  24.1 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.02 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  29.65 
 
 		 492 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  29.26 
 
 		 492 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  24.25 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  24.25 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.65 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  29.85 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  29.26 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  24.25 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  24.25 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  29.26 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  24.25 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  28.42 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  29.85 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.45 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.45 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.45 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.63 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.63 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  23.24 
 
 		 513 aa  124  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  23.24 
 
 		 513 aa  124  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  28.05 
 
 		 482 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.57 
 
 		 548 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  22.68 
 
 		 513 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.05 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  21.83 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  28.44 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  24.65 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  25.1 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  28.85 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>