More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0013 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
522 aa  1092    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  56.23 
 
 
519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  55.79 
 
 
520 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  57.23 
 
 
519 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  55.81 
 
 
519 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  53.41 
 
 
521 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  51.74 
 
 
519 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  52.83 
 
 
528 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  42.83 
 
 
520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  43.39 
 
 
513 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  40.67 
 
 
516 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  38.43 
 
 
517 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  38.33 
 
 
519 aa  365  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  36.33 
 
 
527 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  36.01 
 
 
512 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  30.06 
 
 
481 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.96 
 
 
492 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  30.96 
 
 
492 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.75 
 
 
492 aa  237  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  30.96 
 
 
492 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  30.96 
 
 
492 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  30.96 
 
 
492 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.75 
 
 
492 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  30.75 
 
 
492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.93 
 
 
512 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.52 
 
 
500 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.69 
 
 
503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.71 
 
 
501 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.64 
 
 
509 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.89 
 
 
509 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.22 
 
 
509 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.78 
 
 
512 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.7 
 
 
500 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.35 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.32 
 
 
518 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  30.67 
 
 
438 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.21 
 
 
499 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.54 
 
 
506 aa  179  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.57 
 
 
499 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.98 
 
 
548 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.31 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.34 
 
 
506 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.4 
 
 
502 aa  173  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.34 
 
 
497 aa  170  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  25.9 
 
 
496 aa  169  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.98 
 
 
502 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.33 
 
 
511 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.56 
 
 
530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.36 
 
 
492 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.36 
 
 
492 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.62 
 
 
513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.48 
 
 
513 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  25.67 
 
 
515 aa  166  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.62 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.62 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.19 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.92 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.62 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.18 
 
 
524 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.14 
 
 
513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  24.77 
 
 
512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.71 
 
 
514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.48 
 
 
513 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24 
 
 
509 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  25.52 
 
 
519 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  25.14 
 
 
512 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.97 
 
 
508 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.58 
 
 
496 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.68 
 
 
511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.42 
 
 
504 aa  156  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.9 
 
 
514 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  25.58 
 
 
519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.28 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.21 
 
 
511 aa  154  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.53 
 
 
510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  23.76 
 
 
513 aa  153  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  28.89 
 
 
514 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  28.95 
 
 
521 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  26.07 
 
 
501 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.31 
 
 
499 aa  151  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.2 
 
 
512 aa  151  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  25.81 
 
 
498 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  28.09 
 
 
506 aa  150  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  25.81 
 
 
498 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  26 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  28.16 
 
 
520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.72 
 
 
505 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  27.2 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  29.13 
 
 
472 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  25.62 
 
 
498 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.39 
 
 
489 aa  147  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  26.71 
 
 
505 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>