More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0596 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  59.3 
 
 		 519 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  84.41 
 
 		 528 aa  905    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  60.19 
 
 		 520 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  100 
 
 		 521 aa  1081    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  60.19 
 
 		 519 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  61.91 
 
 		 519 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  57.98 
 
 		 519 aa  618  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  53.41 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  47.41 
 
 		 520 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  43.02 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  41.33 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  41.88 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  40.55 
 
 		 519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  40.59 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  39.22 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  32.22 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.73 
 
 		 503 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  29.15 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  29.04 
 
 		 492 aa  206  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  29.15 
 
 		 492 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  29.15 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  29.15 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.69 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  29.15 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  28.85 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  29.15 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.21 
 
 		 518 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.78 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.04 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.19 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  29.43 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.92 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.83 
 
 		 501 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.08 
 
 		 502 aa  189  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.02 
 
 		 497 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.63 
 
 		 509 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.16 
 
 		 500 aa  176  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.68 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.52 
 
 		 505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.71 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  29.48 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  26.31 
 
 		 499 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  30.38 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.32 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.5 
 
 		 506 aa  170  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.49 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  30.71 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.09 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.34 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.81 
 
 		 511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  25.86 
 
 		 524 aa  163  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  30.1 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  28.89 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  30.1 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  30.1 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  27.39 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.52 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.71 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.3 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.1 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  27.98 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  26.37 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.71 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  24.76 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.26 
 
 		 499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  31.57 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.06 
 
 		 514 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.84 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.7 
 
 		 504 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  28.49 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  28.35 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  26.9 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  29.08 
 
 		 495 aa  153  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  26.21 
 
 		 519 aa  153  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.69 
 
 		 489 aa  153  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.14 
 
 		 496 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  27.94 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.27 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.55 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  28.43 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  29.66 
 
 		 515 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  26.59 
 
 		 508 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.57 
 
 		 509 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  28.49 
 
 		 514 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  26.07 
 
 		 511 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  28.13 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  28.13 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  28.13 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  28.13 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  24.71 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.51 
 
 		 530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  28.13 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  28.13 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  28.13 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  30.56 
 
 		 502 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  26.72 
 
 		 505 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  28.34 
 
 		 495 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>