More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02583 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  100 
 
 
492 aa  1024    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  99.59 
 
 
492 aa  1018    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
492 aa  1024    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  97.76 
 
 
492 aa  1007    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  98.98 
 
 
492 aa  1014    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  1024    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  99.19 
 
 
492 aa  1011    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  98.98 
 
 
492 aa  1014    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  48.63 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  31.86 
 
 
520 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  31.29 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  30.14 
 
 
519 aa  229  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  30.33 
 
 
519 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  30.39 
 
 
519 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  30.96 
 
 
522 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  29.45 
 
 
528 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  29.15 
 
 
521 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  26.52 
 
 
520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  25.85 
 
 
517 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  27.13 
 
 
519 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  27.39 
 
 
516 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  26.46 
 
 
513 aa  192  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  26.63 
 
 
527 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  26.08 
 
 
512 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.85 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.65 
 
 
518 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  25.8 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  26.42 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.28 
 
 
501 aa  133  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.45 
 
 
509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.95 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.75 
 
 
500 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.23 
 
 
512 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  26.29 
 
 
521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  24.05 
 
 
497 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.19 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.28 
 
 
506 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25 
 
 
509 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.98 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.05 
 
 
502 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  23.56 
 
 
503 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.95 
 
 
504 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  24.71 
 
 
510 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  22.97 
 
 
506 aa  114  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.21 
 
 
530 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  22.8 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.02 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.6 
 
 
521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  24.02 
 
 
530 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.02 
 
 
530 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  23.94 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.02 
 
 
530 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.5 
 
 
530 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  23.4 
 
 
506 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  24.34 
 
 
498 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.29 
 
 
505 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.94 
 
 
499 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  23.98 
 
 
509 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.75 
 
 
497 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  23.67 
 
 
495 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  22.95 
 
 
501 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  23.16 
 
 
501 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  22.77 
 
 
499 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  25.9 
 
 
506 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  23.99 
 
 
524 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  23.35 
 
 
511 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.43 
 
 
530 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  24.56 
 
 
498 aa  101  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.52 
 
 
516 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.43 
 
 
530 aa  100  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.43 
 
 
530 aa  99.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  23.12 
 
 
493 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  26.11 
 
 
515 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.31 
 
 
516 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  22.97 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  26.55 
 
 
515 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.52 
 
 
516 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.52 
 
 
516 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25 
 
 
492 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.52 
 
 
516 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25 
 
 
492 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  24.22 
 
 
519 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  23.33 
 
 
507 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  23.33 
 
 
507 aa  98.2  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  23.33 
 
 
507 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.22 
 
 
509 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  23.25 
 
 
494 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  21.92 
 
 
504 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  26.33 
 
 
515 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  24.62 
 
 
505 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  22.56 
 
 
495 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  23.14 
 
 
511 aa  97.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  23.09 
 
 
494 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  22.11 
 
 
502 aa  96.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  23.35 
 
 
499 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.96 
 
 
496 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  22.67 
 
 
509 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  22.88 
 
 
500 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  26.83 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  23.8 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>