More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0937 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  99.59 
 
 		 492 aa  1018    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  99.59 
 
 		 492 aa  1018    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  99.59 
 
 		 492 aa  1018    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  99.39 
 
 		 492 aa  1018    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  98.98 
 
 		 492 aa  1013    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  97.76 
 
 		 492 aa  1006    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 492 aa  1023    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  99.59 
 
 		 492 aa  1017    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  48.63 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  31.86 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  31.29 
 
 		 519 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  30.14 
 
 		 519 aa  230  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  30.33 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  30.39 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  30.96 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  29.64 
 
 		 528 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  29.15 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  26.52 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  25.84 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  27.13 
 
 		 519 aa  192  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  26.26 
 
 		 513 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  27.18 
 
 		 516 aa  190  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  26.63 
 
 		 527 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  25.88 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.65 
 
 		 518 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.85 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.68 
 
 		 501 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  25.8 
 
 		 519 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  26.42 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.45 
 
 		 509 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.95 
 
 		 496 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.55 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.23 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  26.29 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.47 
 
 		 506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  24.05 
 
 		 497 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.19 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.98 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.05 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.15 
 
 		 504 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  23.37 
 
 		 503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.21 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  24.9 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  22.97 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.75 
 
 		 530 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.02 
 
 		 530 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.6 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  24.02 
 
 		 530 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.02 
 
 		 530 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  24.14 
 
 		 511 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.02 
 
 		 530 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  22.8 
 
 		 502 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  23.4 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  24.34 
 
 		 498 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.29 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.94 
 
 		 499 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  23.98 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.95 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  23.16 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  23.41 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  25.9 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  23.67 
 
 		 495 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.43 
 
 		 530 aa  103  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  23.99 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.73 
 
 		 516 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  23.55 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.43 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.43 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.52 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.73 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.73 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  26.33 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.73 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  22.77 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  26.77 
 
 		 515 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  24.56 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.42 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  22.97 
 
 		 498 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25 
 
 		 492 aa  100  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  24.12 
 
 		 519 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25 
 
 		 492 aa  100  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  24.62 
 
 		 505 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  26.55 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  23.14 
 
 		 511 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  22.99 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  22.99 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  22.99 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.82 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  22.31 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  23.32 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  23.69 
 
 		 499 aa  97.8  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.15 
 
 		 496 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  23.67 
 
 		 508 aa  97.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  23.25 
 
 		 494 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  26.83 
 
 		 515 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  23.14 
 
 		 511 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  26.83 
 
 		 515 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  26.83 
 
 		 515 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  23.8 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>