More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2703 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 521 aa  1057    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1660  carbohydrate kinase, FGGY  42.97 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  34.87 
 
 		 438 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.6 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.1 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.03 
 
 		 509 aa  225  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.91 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.24 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.01 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.42 
 
 		 500 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  29.13 
 
 		 512 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.74 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.77 
 
 		 512 aa  202  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.91 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.28 
 
 		 503 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.14 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.86 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  29.83 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.71 
 
 		 498 aa  193  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.83 
 
 		 502 aa  192  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.12 
 
 		 497 aa  192  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.66 
 
 		 499 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.65 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.65 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.57 
 
 		 486 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  27.01 
 
 		 506 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  32.59 
 
 		 481 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.77 
 
 		 496 aa  183  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.86 
 
 		 512 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.77 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  28.57 
 
 		 526 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.97 
 
 		 515 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  32.19 
 
 		 515 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  28.44 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.49 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.74 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.48 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  29.06 
 
 		 508 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.45 
 
 		 506 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.14 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  30.39 
 
 		 501 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  30.14 
 
 		 493 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  31.26 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  31.48 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  30.5 
 
 		 524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.74 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.11 
 
 		 502 aa  173  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  30.54 
 
 		 514 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.82 
 
 		 511 aa  173  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  27.93 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  32.29 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  31.43 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  30.08 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.85 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  30.53 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  30.86 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  27.62 
 
 		 520 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  30.53 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  30.53 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.47 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.62 
 
 		 506 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  29.86 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  29.66 
 
 		 493 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.22 
 
 		 499 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  29.47 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.73 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  28.69 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.32 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  29.26 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  27.73 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  26.04 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  29.26 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  29.93 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.34 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  29.28 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  26.63 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  28.82 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  29.76 
 
 		 511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28.88 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  28.77 
 
 		 505 aa  163  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  29.41 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  27.4 
 
 		 482 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.8 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  29.94 
 
 		 491 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.69 
 
 		 495 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  29.41 
 
 		 517 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  31.83 
 
 		 498 aa  160  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2979  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.66 
 
 		 591 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.509004  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  23.97 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.61 
 
 		 512 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  27.17 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.17 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.54 
 
 		 513 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  27.17 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.89 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  32.17 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.45 
 
 		 513 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  30.86 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  30.86 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  30.6 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>