More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1660 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1660  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
496 aa  963    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  43.79 
 
 
521 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  40.84 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  30.58 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.33 
 
 
496 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.51 
 
 
500 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.72 
 
 
509 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.53 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  31.42 
 
 
528 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.12 
 
 
503 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  31.68 
 
 
521 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  31.67 
 
 
519 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.14 
 
 
538 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  33.6 
 
 
548 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  32.19 
 
 
526 aa  206  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  32.19 
 
 
519 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.92 
 
 
501 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  34.33 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  31.8 
 
 
519 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.57 
 
 
488 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  32.5 
 
 
515 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  37.76 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  31.4 
 
 
514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.95 
 
 
509 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.72 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.25 
 
 
499 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  26.35 
 
 
506 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.66 
 
 
511 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  32.12 
 
 
524 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.66 
 
 
498 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.22 
 
 
499 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.42 
 
 
495 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  30.1 
 
 
514 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.06 
 
 
514 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.35 
 
 
512 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.06 
 
 
530 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  36.49 
 
 
498 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  31.5 
 
 
520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  31.91 
 
 
515 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  31.91 
 
 
515 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  31.2 
 
 
519 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  31.91 
 
 
515 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 
497 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.6 
 
 
512 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  34.36 
 
 
501 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  29.35 
 
 
520 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  30.33 
 
 
519 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.86 
 
 
505 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  31.43 
 
 
508 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  31.78 
 
 
515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  32.5 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  32.5 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  32.5 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.33 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  32.5 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  32.19 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  32.5 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  32.5 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  31.72 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  32.3 
 
 
513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.27 
 
 
504 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.77 
 
 
511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  25.9 
 
 
512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  26.6 
 
 
512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.15 
 
 
492 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  31.61 
 
 
482 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.15 
 
 
492 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  35.04 
 
 
487 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.26 
 
 
512 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  27.4 
 
 
489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.64 
 
 
489 aa  181  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.45 
 
 
518 aa  180  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.27 
 
 
513 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.54 
 
 
512 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  26.2 
 
 
512 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.26 
 
 
499 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.96 
 
 
513 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  28.49 
 
 
519 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.48 
 
 
496 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.08 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.08 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.08 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.08 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26 
 
 
512 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26 
 
 
511 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.08 
 
 
513 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.38 
 
 
501 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  30.1 
 
 
517 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.05 
 
 
506 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  30.65 
 
 
511 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  30.1 
 
 
517 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  28.85 
 
 
516 aa  176  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.88 
 
 
513 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  33.94 
 
 
496 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  30.89 
 
 
527 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  33.27 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.47 
 
 
506 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  34.14 
 
 
481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  33 
 
 
498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>