More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4202 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4202  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 		 466 aa  869    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  45.62 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  49.77 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  42.67 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  41.08 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  30.18 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  37.21 
 
 		 477 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  31.21 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.03 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.19 
 
 		 483 aa  216  7e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.14 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.7 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  37.24 
 
 		 498 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.89 
 
 		 509 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  33.33 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.8 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  41.09 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  41.09 
 
 		 474 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  38.24 
 
 		 481 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  40.86 
 
 		 474 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.83 
 
 		 500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.55 
 
 		 487 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  32.88 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.69 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.69 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  31.89 
 
 		 488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  34.09 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.13 
 
 		 499 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.15 
 
 		 511 aa  196  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  37.88 
 
 		 496 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  35.12 
 
 		 487 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.69 
 
 		 496 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.41 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.88 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  33.26 
 
 		 484 aa  194  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.26 
 
 		 484 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.26 
 
 		 484 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.26 
 
 		 484 aa  193  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.26 
 
 		 484 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  33.26 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.03 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  32.78 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  37.17 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  32.42 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  38.36 
 
 		 483 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.46 
 
 		 499 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.07 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.63 
 
 		 512 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  34.91 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  32.8 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  35.24 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.61 
 
 		 502 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  39.46 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  35.98 
 
 		 478 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  39.46 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  29.79 
 
 		 492 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  40.1 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  33.56 
 
 		 486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  32.36 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.54 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.33 
 
 		 486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.5 
 
 		 509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.16 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  36.19 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  32.15 
 
 		 483 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  35.71 
 
 		 508 aa  183  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  32.44 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  31.13 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.96 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  36.32 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  36.32 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.65 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.67 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  32.05 
 
 		 485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.07 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  32.65 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  38.67 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.65 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  33.82 
 
 		 481 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  38.46 
 
 		 503 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  37.78 
 
 		 501 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  31.96 
 
 		 485 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  36.1 
 
 		 490 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  36.1 
 
 		 490 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  36.1 
 
 		 490 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  35.36 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  36.1 
 
 		 490 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  35.16 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  29.94 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.21 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  30.98 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  30.98 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.33 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.52 
 
 		 488 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  35.91 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  35.36 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  32.59 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  35.51 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>