More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 
513 aa  994    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  47.91 
 
 
524 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  38.01 
 
 
518 aa  354  2e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  44.16 
 
 
526 aa  350  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  45.26 
 
 
501 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  37.22 
 
 
512 aa  343  5e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  37.07 
 
 
513 aa  342  9e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  37.07 
 
 
512 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  36.86 
 
 
513 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  36.86 
 
 
513 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  36.86 
 
 
513 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  36.86 
 
 
513 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  36.66 
 
 
513 aa  340  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  36.86 
 
 
513 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  35.54 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  36.86 
 
 
513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  45.28 
 
 
530 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  41.53 
 
 
530 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  35.76 
 
 
512 aa  332  8e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  36.51 
 
 
512 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  38.51 
 
 
514 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  38.18 
 
 
511 aa  329  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  34.98 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  38.18 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  36.51 
 
 
512 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  37.95 
 
 
512 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  45.57 
 
 
476 aa  322  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  34.32 
 
 
511 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  38.98 
 
 
519 aa  319  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  34.32 
 
 
511 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  34.21 
 
 
511 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  34.12 
 
 
511 aa  315  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  36.97 
 
 
509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  35.08 
 
 
513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  33.99 
 
 
517 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  33.99 
 
 
517 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  32.86 
 
 
509 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  35.33 
 
 
489 aa  296  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  32.34 
 
 
502 aa  295  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  33.81 
 
 
486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.97 
 
 
495 aa  263  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  30.78 
 
 
476 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  30.78 
 
 
476 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  35.66 
 
 
496 aa  242  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.08 
 
 
500 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.2 
 
 
489 aa  233  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  33.72 
 
 
518 aa  223  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.13 
 
 
511 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.21 
 
 
509 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.98 
 
 
498 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.16 
 
 
501 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.6 
 
 
512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.5 
 
 
502 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  34.7 
 
 
501 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  36.34 
 
 
333 aa  210  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.68 
 
 
509 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.69 
 
 
509 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.49 
 
 
515 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  37.25 
 
 
499 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  34.6 
 
 
506 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.89 
 
 
500 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  34.47 
 
 
504 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  30.24 
 
 
499 aa  201  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  35.61 
 
 
483 aa  200  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  30.71 
 
 
512 aa  199  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  31.29 
 
 
517 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  31.29 
 
 
517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  33.26 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.7 
 
 
497 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.18 
 
 
511 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.57 
 
 
499 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.17 
 
 
511 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  25.92 
 
 
511 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.62 
 
 
492 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.62 
 
 
492 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.24 
 
 
505 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.36 
 
 
506 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.7 
 
 
506 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.69 
 
 
488 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.65 
 
 
499 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.98 
 
 
503 aa  186  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.08 
 
 
538 aa  186  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  33.33 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.7 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  34.15 
 
 
472 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  33.77 
 
 
496 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  32.71 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.41 
 
 
512 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.4 
 
 
496 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  27.88 
 
 
496 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  29.25 
 
 
519 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  28.74 
 
 
510 aa  179  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  31.44 
 
 
493 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  31.44 
 
 
493 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  31.44 
 
 
493 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.22 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  34.35 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.12 
 
 
510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.3 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.86 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>