More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0492 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
476 aa  977    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
476 aa  977    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  38.92 
 
 
530 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  36.67 
 
 
506 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  34.34 
 
 
513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  36.93 
 
 
518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  34.54 
 
 
517 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  34.54 
 
 
517 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  36.53 
 
 
499 aa  302  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  35.38 
 
 
512 aa  301  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  34.94 
 
 
512 aa  299  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  34.94 
 
 
513 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  34.74 
 
 
513 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  34.74 
 
 
513 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  35.32 
 
 
514 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  34.32 
 
 
513 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  34.12 
 
 
513 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  34.12 
 
 
513 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  34.06 
 
 
513 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  34.54 
 
 
513 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  34.74 
 
 
512 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  35.94 
 
 
512 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  34.74 
 
 
512 aa  293  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  34.54 
 
 
512 aa  292  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  34.54 
 
 
512 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  34.54 
 
 
511 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  33.8 
 
 
511 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  33.6 
 
 
511 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.93 
 
 
519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  33.6 
 
 
511 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  33.54 
 
 
501 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  33.8 
 
 
511 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  35.29 
 
 
486 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  34.55 
 
 
489 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  34.89 
 
 
524 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  34.08 
 
 
526 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  33.4 
 
 
509 aa  269  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  32.79 
 
 
509 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  33.13 
 
 
502 aa  265  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.63 
 
 
495 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  30.38 
 
 
513 aa  239  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  31.05 
 
 
499 aa  232  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  32.64 
 
 
476 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.66 
 
 
530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.48 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  30.72 
 
 
497 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  30.58 
 
 
505 aa  212  9e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  31.39 
 
 
534 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.59 
 
 
492 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.72 
 
 
500 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.59 
 
 
492 aa  209  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  30.72 
 
 
505 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  31.33 
 
 
464 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.66 
 
 
489 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  27.7 
 
 
494 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  29.81 
 
 
496 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.06 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.58 
 
 
498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.42 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.25 
 
 
518 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.01 
 
 
501 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  29.01 
 
 
492 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  33.64 
 
 
333 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  28.81 
 
 
472 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.63 
 
 
496 aa  193  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  31.57 
 
 
511 aa  193  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.68 
 
 
512 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.38 
 
 
506 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  31.14 
 
 
517 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  31.14 
 
 
517 aa  190  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.97 
 
 
511 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.26 
 
 
502 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.51 
 
 
511 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.14 
 
 
504 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  29.67 
 
 
510 aa  187  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27 
 
 
515 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  29.45 
 
 
481 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  30.79 
 
 
499 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.56 
 
 
538 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.91 
 
 
509 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  28.22 
 
 
505 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.2 
 
 
509 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.8 
 
 
483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.64 
 
 
506 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.89 
 
 
503 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.16 
 
 
500 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.29 
 
 
506 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  26.54 
 
 
499 aa  170  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  26.58 
 
 
487 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  27.27 
 
 
486 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.68 
 
 
512 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  27.54 
 
 
496 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  26.95 
 
 
486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  27.74 
 
 
499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25.51 
 
 
484 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.49 
 
 
506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  26.28 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  25.15 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.35 
 
 
510 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  25.67 
 
 
483 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>