More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1675 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
492 aa  958    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  46.68 
 
 
534 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  45.25 
 
 
494 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  42.12 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  37.14 
 
 
499 aa  259  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  35.9 
 
 
496 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  29.52 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  31.92 
 
 
514 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  30.04 
 
 
476 aa  224  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  30.04 
 
 
476 aa  224  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  29.96 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.66 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  29.44 
 
 
513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  29.44 
 
 
513 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  29.44 
 
 
513 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  30.1 
 
 
512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  29.56 
 
 
513 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  29.46 
 
 
512 aa  220  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  29.56 
 
 
513 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  29.23 
 
 
513 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  31.22 
 
 
509 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  28.35 
 
 
511 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  29.31 
 
 
513 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  32.73 
 
 
519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  28.35 
 
 
511 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  28.13 
 
 
511 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  28.13 
 
 
511 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  29.46 
 
 
517 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  29.46 
 
 
517 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  31.69 
 
 
518 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  27.77 
 
 
513 aa  206  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  29.56 
 
 
512 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  34.09 
 
 
524 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.06 
 
 
495 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  29.18 
 
 
486 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  33 
 
 
526 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  30.26 
 
 
512 aa  200  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  27.58 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  29.37 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  27.58 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  34.22 
 
 
501 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  27.58 
 
 
512 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3181  carbohydrate kinase FGGY  35.63 
 
 
455 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  28.36 
 
 
499 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  28.05 
 
 
509 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2959  carbohydrate kinase, FGGY  35.77 
 
 
477 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  27.13 
 
 
502 aa  183  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  28.63 
 
 
489 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  31.56 
 
 
513 aa  174  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50182  predicted protein  28.91 
 
 
554 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  34.45 
 
 
476 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  30.41 
 
 
499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.2 
 
 
497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.91 
 
 
483 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.74 
 
 
501 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  28.17 
 
 
496 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  29.84 
 
 
538 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.1 
 
 
530 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.74 
 
 
505 aa  144  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.42 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.42 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.74 
 
 
503 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.79 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.01 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.38 
 
 
548 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  25.17 
 
 
512 aa  131  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.15 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.47 
 
 
524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.1 
 
 
490 aa  130  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.03 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.4 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.95 
 
 
496 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.08 
 
 
498 aa  128  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.6 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  30.7 
 
 
489 aa  127  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.11 
 
 
512 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.3 
 
 
499 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.25 
 
 
500 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  27.6 
 
 
511 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  31.88 
 
 
472 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  27.23 
 
 
517 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.4 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  26.42 
 
 
497 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  27.23 
 
 
517 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  29.1 
 
 
333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.15 
 
 
500 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.49 
 
 
496 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  26.48 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  26.64 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.71 
 
 
509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  29.46 
 
 
492 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  28.44 
 
 
520 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  28.6 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 
506 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  27.05 
 
 
497 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  28.82 
 
 
495 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  26.71 
 
 
514 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  29.67 
 
 
485 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0500  putative glycerol kinase  26.99 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102563  normal  0.0309085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.64 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>