290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3181 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3181  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
455 aa  875    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2959  carbohydrate kinase, FGGY  80.84 
 
 
477 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  35.76 
 
 
494 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  35.81 
 
 
534 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  36.08 
 
 
492 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  32.85 
 
 
499 aa  170  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  29.85 
 
 
464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  28.48 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  26.43 
 
 
512 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  25.9 
 
 
476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  25.9 
 
 
476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50182  predicted protein  26.76 
 
 
554 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  25.68 
 
 
518 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.48 
 
 
509 aa  124  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  23.67 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  24.89 
 
 
517 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  24.89 
 
 
517 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.13 
 
 
513 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.23 
 
 
506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.14 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.71 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  27.14 
 
 
513 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  27.2 
 
 
513 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.2 
 
 
513 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  27.2 
 
 
513 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.65 
 
 
513 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  22.7 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.95 
 
 
513 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  22.48 
 
 
511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  22.48 
 
 
511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  22.27 
 
 
511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  25.77 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.82 
 
 
530 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  26.34 
 
 
509 aa  110  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  23.46 
 
 
512 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.96 
 
 
514 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  23.8 
 
 
512 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  23.09 
 
 
511 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  23.09 
 
 
512 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  30.56 
 
 
526 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  25.42 
 
 
489 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  24.28 
 
 
502 aa  106  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  25.72 
 
 
510 aa  103  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  23.14 
 
 
513 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  26.92 
 
 
519 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.88 
 
 
530 aa  99.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  22.55 
 
 
512 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  30.13 
 
 
501 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  28.71 
 
 
476 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.97 
 
 
483 aa  96.3  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  29.4 
 
 
513 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2805  carbohydrate kinase FGGY  24.12 
 
 
493 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.17 
 
 
499 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.55 
 
 
495 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  29.9 
 
 
481 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.87 
 
 
486 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  28.7 
 
 
524 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  22.82 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  23.21 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  25.88 
 
 
548 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.96 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  27.53 
 
 
509 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  27.85 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  25.99 
 
 
499 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  26.82 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.23 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.77 
 
 
497 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45190  putative glycerol kinase  26.93 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0889637  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  26.59 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  23.64 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  22.99 
 
 
503 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  27.39 
 
 
492 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.73 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  23.66 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2692  carbohydrate kinase FGGY  22.88 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0288488  hitchhiker  0.00183322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  26.63 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.23 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1654  glycerol kinase  23.52 
 
 
529 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  25.38 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  21.71 
 
 
492 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  21.71 
 
 
492 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  22.8 
 
 
496 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  27 
 
 
497 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  25.49 
 
 
510 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  26.81 
 
 
496 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3437  carbohydrate kinase FGGY  26.14 
 
 
498 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0110073  hitchhiker  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  26.77 
 
 
485 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  21.6 
 
 
505 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  25.6 
 
 
516 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  26.91 
 
 
496 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2441  carbohydrate kinase, FGGY  26.33 
 
 
487 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  29.27 
 
 
478 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  28.25 
 
 
520 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1041  glycerol kinase  24.05 
 
 
536 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  22.98 
 
 
501 aa  63.5  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1721  glycerol kinase  26.68 
 
 
496 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  25 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  30.62 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  27.2 
 
 
491 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1680  carbohydrate kinase, FGGY  26.3 
 
 
484 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.450343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>