More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2441 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2441  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 487 aa  968    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0084  glycerol kinase  62.66 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1948  carbohydrate kinase, FGGY  59.67 
 
 		 490 aa  549  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.148996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  48.65 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  52.26 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  52.37 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  51.85 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  50 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  48.87 
 
 		 494 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  50 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  50 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  49.9 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  49.49 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  50.52 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  47.73 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  47.53 
 
 		 494 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  49.49 
 
 		 504 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  48.77 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  47.02 
 
 		 498 aa  450  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  47.52 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  50 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  50.61 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  49.49 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  49.8 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  49.79 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  49.79 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  49.38 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  49.38 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  49.07 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  49.7 
 
 		 502 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  48.25 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  47.74 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  45.27 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  49.39 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  47.84 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  48.25 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  46.52 
 
 		 498 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  48.05 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  48.25 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  45.06 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  49.38 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  48.05 
 
 		 500 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  50.62 
 
 		 497 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  47.53 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  45.49 
 
 		 496 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  47.84 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  45.49 
 
 		 496 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  50.42 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  48.56 
 
 		 492 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  47.01 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  47.12 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  45.92 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  45.92 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  45.49 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  45.49 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1369  glycerol kinase  45.76 
 
 		 491 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1365  glycerol kinase  45.76 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  46.58 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  45.92 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  48.14 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  51.75 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  45.49 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  45.29 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  46.31 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  45.49 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  50.85 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  48.97 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  45.59 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  49.28 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  46.83 
 
 		 519 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  47.95 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  46 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  46.52 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  44.26 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  46 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  47.12 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  46.83 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  47.94 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  47.84 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  45.49 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  46.83 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  47.44 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  45.59 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  45.59 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  52.16 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  44.26 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  45.38 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  46.2 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  45.29 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  48.05 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  49.18 
 
 		 498 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  44.67 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  45.33 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  47.31 
 
 		 516 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  46.91 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  47.11 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  47.24 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  48.76 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  45.36 
 
 		 494 aa  425  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  45.59 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>