More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1948 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1948  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 490 aa  981    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.148996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0084  glycerol kinase  59.51 
 
 		 489 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2441  carbohydrate kinase, FGGY  59.67 
 
 		 487 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  52.04 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  52.1 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  48.99 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  48.59 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  48.19 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  50 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  48.69 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  48.89 
 
 		 497 aa  455  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  50.91 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  47.26 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  48.37 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  47.76 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  49.9 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  49.5 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  48.79 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  48.79 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  48.29 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  48.37 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  48.88 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  49.59 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  47.36 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  47.28 
 
 		 498 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  48.09 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  50.2 
 
 		 495 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  47.06 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  48.19 
 
 		 497 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  47.08 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  48.09 
 
 		 500 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  47.7 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  49.39 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  49.19 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  48.37 
 
 		 496 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1721  glycerol kinase  47.97 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  46.48 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  51.02 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  48.69 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  46.68 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  47.27 
 
 		 497 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  47.24 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  49.39 
 
 		 500 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  49.6 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  47.66 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  48.68 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  46.94 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  47.76 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  47.14 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  47.14 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  49.6 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  49.39 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  47.14 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  46.86 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  45.7 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  45.29 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  47.44 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  48.07 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  48.07 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  45.75 
 
 		 497 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  48.12 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  45.7 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  46.53 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  45.75 
 
 		 513 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  47.67 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  48.78 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  45.49 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  45.7 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  48.5 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  45.51 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  47.49 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  43.99 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  46.95 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  46.53 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3608  glycerol kinase  46.86 
 
 		 492 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  45.62 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  46.52 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  46.44 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  46.94 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  46.44 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  46.53 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  46.53 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  46.73 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  46.75 
 
 		 497 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3540  glycerol kinase  46.65 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  46.72 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  45.49 
 
 		 500 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  45.33 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3457  glycerol kinase  46.34 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.635428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  44.72 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  46.31 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  45.93 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  46.04 
 
 		 495 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  45.55 
 
 		 497 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  45.21 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  44.83 
 
 		 495 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  44.51 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  43.41 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  43.2 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>