More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4273 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 534 aa  1057    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  81.38 
 
 		 494 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  46.68 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  38.75 
 
 		 464 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  39.92 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  34.48 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  31.16 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  31.16 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  29.32 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  28.82 
 
 		 512 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  31.15 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  28.82 
 
 		 511 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  28.63 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.9 
 
 		 530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  29.86 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  29.8 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  28.93 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3181  carbohydrate kinase FGGY  35.68 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.72 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.93 
 
 		 513 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  26.29 
 
 		 506 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50182  predicted protein  31.92 
 
 		 554 aa  199  9e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  30.65 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  29.98 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  28.71 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  28.51 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.72 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.72 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.72 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2959  carbohydrate kinase, FGGY  36.56 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  28.54 
 
 		 518 aa  196  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  26.98 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  26.98 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  29.17 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  28.19 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.24 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  28.51 
 
 		 513 aa  194  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.77 
 
 		 499 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  29.92 
 
 		 489 aa  190  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  25.74 
 
 		 511 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.74 
 
 		 511 aa  186  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  25.74 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.53 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  26.46 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.54 
 
 		 495 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  26.53 
 
 		 509 aa  177  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  31.57 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  31.84 
 
 		 501 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  30.85 
 
 		 526 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  30.87 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  32.04 
 
 		 513 aa  163  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.9 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.12 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.8 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.97 
 
 		 505 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  27.73 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  32.06 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.83 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.95 
 
 		 497 aa  143  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.8 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.2 
 
 		 502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.59 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  32.34 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.17 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  30.06 
 
 		 510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  30.43 
 
 		 496 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  31.17 
 
 		 472 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.82 
 
 		 512 aa  134  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  28.6 
 
 		 510 aa  134  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.77 
 
 		 508 aa  133  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  25.78 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  29 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  33.05 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  27.86 
 
 		 493 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  27.86 
 
 		 493 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  27.86 
 
 		 493 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.86 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  29.98 
 
 		 499 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  31.97 
 
 		 497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.3 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  28.26 
 
 		 497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  24.32 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  29.42 
 
 		 495 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  30.21 
 
 		 495 aa  127  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.77 
 
 		 483 aa  127  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  27.89 
 
 		 509 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1654  glycerol kinase  25.66 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  29.18 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  29.38 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  27.51 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  27.95 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  30.52 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  26.4 
 
 		 493 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  24.89 
 
 		 503 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  27.02 
 
 		 496 aa  124  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.3 
 
 		 501 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  27.39 
 
 		 498 aa  123  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  29.91 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  29.06 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  28.4 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>