More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2817 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
499 aa  988    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  42.47 
 
 
494 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  41.4 
 
 
534 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  37.14 
 
 
492 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  34.05 
 
 
464 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  29.51 
 
 
476 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  29.51 
 
 
476 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50182  predicted protein  30.24 
 
 
554 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  26.27 
 
 
499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.43 
 
 
530 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.74 
 
 
486 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.22 
 
 
509 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  25.55 
 
 
511 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.55 
 
 
511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  27.94 
 
 
513 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2959  carbohydrate kinase, FGGY  33.85 
 
 
477 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.55 
 
 
511 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  28.14 
 
 
513 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.14 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.14 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.14 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.14 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.14 
 
 
513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.89 
 
 
514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  27.93 
 
 
512 aa  163  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  27.66 
 
 
512 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  25.33 
 
 
511 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.62 
 
 
495 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.82 
 
 
512 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  33.18 
 
 
476 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.54 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  27.74 
 
 
509 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  28.34 
 
 
496 aa  159  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3181  carbohydrate kinase FGGY  32.72 
 
 
455 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  28.75 
 
 
489 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  29.86 
 
 
513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  30.24 
 
 
526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.07 
 
 
518 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  23.52 
 
 
506 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.54 
 
 
499 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  25.49 
 
 
502 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  25.91 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.14 
 
 
512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.14 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  29.48 
 
 
501 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  27.51 
 
 
519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  25.74 
 
 
512 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.68 
 
 
512 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  24.03 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  24.03 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.8 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.35 
 
 
489 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  28.96 
 
 
524 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.63 
 
 
530 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  21.66 
 
 
513 aa  123  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.86 
 
 
497 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.45 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  29.86 
 
 
478 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  30.27 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.72 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  30.3 
 
 
512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.58 
 
 
498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  23.89 
 
 
492 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  28.16 
 
 
483 aa  118  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  23.89 
 
 
492 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.54 
 
 
496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  23.65 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  28.02 
 
 
483 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  22.96 
 
 
505 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  30.57 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  29.86 
 
 
478 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.15 
 
 
502 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.87 
 
 
506 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.08 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  27.23 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.06 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.46 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  24.1 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.08 
 
 
483 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  26.9 
 
 
510 aa  111  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.35 
 
 
504 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.72 
 
 
548 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.05 
 
 
484 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  31.95 
 
 
472 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27.83 
 
 
515 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  27.76 
 
 
485 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  27.7 
 
 
333 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  26.99 
 
 
484 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  27.76 
 
 
484 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  27.09 
 
 
492 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  26.2 
 
 
511 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.79 
 
 
512 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.2 
 
 
509 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  29.06 
 
 
505 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  29.19 
 
 
491 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25 
 
 
518 aa  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  25.62 
 
 
517 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  25.84 
 
 
517 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  26.83 
 
 
524 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  30.21 
 
 
501 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>