More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2959 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3181  carbohydrate kinase FGGY  80.84 
 
 		 455 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2959  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 477 aa  927    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  36.58 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  35.77 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  36.49 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  33.56 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  29.85 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  25.69 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  29.17 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.38 
 
 		 518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.45 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  23.35 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50182  predicted protein  26.07 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.95 
 
 		 513 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  25.32 
 
 		 517 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  25.32 
 
 		 517 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.51 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.51 
 
 		 513 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.51 
 
 		 513 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  27.51 
 
 		 513 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  27.51 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  23.83 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  27.51 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  23.83 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  25.86 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.25 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.04 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  30.42 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  30.04 
 
 		 526 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.71 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.88 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.89 
 
 		 514 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  22.74 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  22.92 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  23.48 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  22.82 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  22.92 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  22.82 
 
 		 511 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  22.94 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.3 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.17 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  27.84 
 
 		 519 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  22.13 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  25.17 
 
 		 489 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  22.13 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  22.43 
 
 		 512 aa  99.8  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  23.16 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  24.84 
 
 		 502 aa  96.7  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.97 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.89 
 
 		 530 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  26.57 
 
 		 499 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  27.7 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  28.48 
 
 		 501 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.81 
 
 		 548 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  22.05 
 
 		 490 aa  91.3  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  29.23 
 
 		 513 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2805  carbohydrate kinase FGGY  22.47 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  21.87 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  25.74 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  21.68 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  28.5 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.62 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  25.51 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45190  putative glycerol kinase  26.71 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0889637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  30.53 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.32 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  25.5 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2692  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0288488  hitchhiker  0.00183322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  26.12 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  22.52 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  25.36 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  28.08 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  26.53 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  24.19 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  26.35 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  26.91 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  25.3 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  21.31 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  21.31 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  23.88 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.73 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  24.13 
 
 		 484 aa  67  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  23.5 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  24.43 
 
 		 501 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  30.38 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  25.69 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  22.25 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  22.77 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  25.16 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  29.46 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  21.41 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0150  gluconate kinase  24.41 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.731797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  24.95 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  25.29 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  25.97 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  28.36 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  25.5 
 
 		 498 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3437  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 		 498 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0110073  hitchhiker  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1041  glycerol kinase  23.9 
 
 		 536 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>