More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 
496 aa  991    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  34.71 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  35.47 
 
 
534 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  35.9 
 
 
492 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  28.73 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.87 
 
 
514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  29.55 
 
 
526 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.15 
 
 
513 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  24.29 
 
 
512 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.15 
 
 
513 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.15 
 
 
513 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.15 
 
 
513 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.75 
 
 
513 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.95 
 
 
513 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.64 
 
 
530 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.15 
 
 
513 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  27.08 
 
 
512 aa  174  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  27.55 
 
 
512 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  23.98 
 
 
512 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.1 
 
 
513 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  30 
 
 
524 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  26.45 
 
 
512 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  27.23 
 
 
512 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  27.23 
 
 
511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  27.57 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  31.44 
 
 
501 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.2 
 
 
509 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  27.02 
 
 
519 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  23.23 
 
 
506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  26.21 
 
 
511 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.77 
 
 
511 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.99 
 
 
511 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  24.12 
 
 
511 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  23.32 
 
 
502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  27.1 
 
 
499 aa  148  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  25.96 
 
 
476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  24.9 
 
 
512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  25.96 
 
 
476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  23.53 
 
 
517 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  23.53 
 
 
517 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50182  predicted protein  27.33 
 
 
554 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  24.94 
 
 
499 aa  141  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  23.11 
 
 
486 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3181  carbohydrate kinase FGGY  29.14 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  23.63 
 
 
513 aa  136  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  23.14 
 
 
509 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.08 
 
 
495 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  24.21 
 
 
518 aa  131  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2959  carbohydrate kinase, FGGY  29.17 
 
 
477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.36 
 
 
548 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  31.4 
 
 
513 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.14 
 
 
497 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.85 
 
 
499 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  22.34 
 
 
490 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.49 
 
 
510 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  20.76 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.46 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  25.63 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.06 
 
 
509 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.95 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  26.46 
 
 
508 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  22.77 
 
 
500 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  24.62 
 
 
514 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.54 
 
 
524 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  23.69 
 
 
505 aa  107  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.85 
 
 
483 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25.1 
 
 
484 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  22.9 
 
 
492 aa  106  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  27.68 
 
 
494 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  22.9 
 
 
492 aa  106  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  25.55 
 
 
483 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  25.49 
 
 
489 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  21.55 
 
 
496 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  25.55 
 
 
487 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.44 
 
 
499 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.06 
 
 
538 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  27.47 
 
 
494 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  27.47 
 
 
494 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  25.35 
 
 
483 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  28.48 
 
 
489 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  26.71 
 
 
492 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  26.4 
 
 
485 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  26.73 
 
 
499 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  27.77 
 
 
476 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  27.16 
 
 
472 aa  99.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  24.95 
 
 
512 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  25.44 
 
 
498 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  29.85 
 
 
463 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  25.98 
 
 
484 aa  99.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  26.85 
 
 
505 aa  99.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  27.38 
 
 
502 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  25.35 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.45 
 
 
500 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  25.28 
 
 
484 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  25.92 
 
 
505 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  25.58 
 
 
483 aa  97.1  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.29 
 
 
518 aa  96.7  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.43 
 
 
505 aa  96.7  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.03 
 
 
496 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  26.92 
 
 
499 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>