More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0500 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1835  putative glycerol kinase  81.8 
 
 
501 aa  820    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0651964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0500  putative glycerol kinase  100 
 
 
501 aa  1002    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102563  normal  0.0309085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  49.6 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  45.09 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  44.49 
 
 
496 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  49.09 
 
 
516 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  46.67 
 
 
496 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  46.77 
 
 
520 aa  431  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  47.46 
 
 
498 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  47.46 
 
 
498 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  47.28 
 
 
495 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  47.2 
 
 
497 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  46.44 
 
 
498 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  42.6 
 
 
494 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  45.69 
 
 
497 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  45.71 
 
 
495 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  46.39 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  46.28 
 
 
495 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  42.25 
 
 
498 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  44.91 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  45.27 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  45.27 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  45.07 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  46.11 
 
 
498 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  44.89 
 
 
494 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  45.49 
 
 
494 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  44.69 
 
 
494 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  46.29 
 
 
498 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  44.56 
 
 
498 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  44.65 
 
 
498 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  45.09 
 
 
494 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  41.82 
 
 
497 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  47.5 
 
 
497 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  44.89 
 
 
494 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  44.69 
 
 
497 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  42.74 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  42.2 
 
 
501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  46.46 
 
 
502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  44.47 
 
 
505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  43.72 
 
 
497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  42.43 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  44.99 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  43.64 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  44.13 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  44.69 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  44.33 
 
 
483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  45.75 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  42.42 
 
 
489 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  41.8 
 
 
501 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  46.64 
 
 
496 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  42.35 
 
 
499 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  43.63 
 
 
505 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  42.18 
 
 
502 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  45.29 
 
 
497 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  44.49 
 
 
507 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  45.97 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  40.81 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  41.5 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  42.83 
 
 
497 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  46.65 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  45.62 
 
 
484 aa  402  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  42.71 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  44.85 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  45.86 
 
 
496 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  41.52 
 
 
503 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  41.26 
 
 
498 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  41.83 
 
 
501 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  41.72 
 
 
507 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  41.63 
 
 
500 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  43.32 
 
 
495 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  45.44 
 
 
496 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  43.52 
 
 
513 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  41.72 
 
 
507 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  43.06 
 
 
499 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  42.83 
 
 
497 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  44.65 
 
 
501 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  45.29 
 
 
505 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  42.12 
 
 
503 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  43.26 
 
 
499 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  41.4 
 
 
500 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  41.26 
 
 
498 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  45.91 
 
 
504 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  43.91 
 
 
509 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  41.5 
 
 
502 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  41.5 
 
 
502 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  41.11 
 
 
502 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  41.72 
 
 
507 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  41.5 
 
 
502 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  41.95 
 
 
501 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  46.25 
 
 
506 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  44.53 
 
 
501 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  44.38 
 
 
511 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>