More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0885 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  99.58 
 
 		 482 aa  973    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  100 
 
 		 472 aa  977    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  99.79 
 
 		 482 aa  976    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  99.58 
 
 		 482 aa  973    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  99.36 
 
 		 472 aa  972    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  84.32 
 
 		 472 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  99.79 
 
 		 472 aa  976    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  84.32 
 
 		 472 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  99.58 
 
 		 472 aa  973    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  84.75 
 
 		 472 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  84.53 
 
 		 472 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  84.96 
 
 		 472 aa  849    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  99.36 
 
 		 472 aa  972    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  52.24 
 
 		 474 aa  498  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  45 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.06 
 
 		 497 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  30.25 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.92 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.26 
 
 		 498 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  29.27 
 
 		 515 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.19 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.21 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  29.15 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  27.9 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  27.9 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  27.9 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  26.4 
 
 		 514 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.26 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  28.67 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.23 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.62 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  28.92 
 
 		 515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  27.65 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.37 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.1 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.06 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.58 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.59 
 
 		 504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.19 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  26.31 
 
 		 514 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.74 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  28.91 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.93 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.16 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  24.9 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.97 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  27.27 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  26.5 
 
 		 500 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  26.56 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.44 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.19 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  26.8 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  23.04 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.93 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  24.05 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.42 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  24.89 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.71 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  25.82 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  25.93 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.43 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.12 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  26.72 
 
 		 519 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  22.83 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  27.06 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  26.06 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  22.95 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  25.87 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.49 
 
 		 520 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 		 509 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  28.85 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  25.9 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  26.2 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  24.38 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  26.34 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  25.15 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  25.6 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  23.15 
 
 		 517 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  25.15 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.43 
 
 		 548 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  26.8 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  25.64 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  24.95 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  24.32 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  24.95 
 
 		 530 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  23.67 
 
 		 496 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  25.61 
 
 		 519 aa  120  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  25.2 
 
 		 519 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.84 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  24.4 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.89 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  24.95 
 
 		 519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  27.69 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  26.67 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>