More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09600 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  100 
 
 
476 aa  977    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  49.04 
 
 
489 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  47.35 
 
 
473 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  42.86 
 
 
493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  46.74 
 
 
493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  45.53 
 
 
500 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  44.44 
 
 
497 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  44.33 
 
 
499 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  42.25 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  42.35 
 
 
477 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  43.19 
 
 
485 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  41.09 
 
 
480 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  44.3 
 
 
498 aa  395  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  41.15 
 
 
528 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  41.26 
 
 
499 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  41.44 
 
 
516 aa  382  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  41.81 
 
 
474 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  38.96 
 
 
523 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  42.65 
 
 
472 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  41.39 
 
 
476 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  40.81 
 
 
488 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  42.58 
 
 
485 aa  359  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  40.13 
 
 
499 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  38.94 
 
 
495 aa  352  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  40.47 
 
 
467 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  39.58 
 
 
496 aa  345  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.13 
 
 
470 aa  342  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  38.53 
 
 
489 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  36.17 
 
 
477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.77 
 
 
490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  38.22 
 
 
490 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  37.79 
 
 
479 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  38.91 
 
 
502 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  38.32 
 
 
489 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  38.66 
 
 
489 aa  335  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  38.11 
 
 
489 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  38.53 
 
 
489 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  38.11 
 
 
489 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  39.19 
 
 
470 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  38.32 
 
 
489 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  38.11 
 
 
489 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  37.5 
 
 
490 aa  329  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  38.49 
 
 
506 aa  325  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  38.87 
 
 
496 aa  325  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  36.42 
 
 
518 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  37.29 
 
 
464 aa  318  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  37.74 
 
 
481 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  37.74 
 
 
481 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  37.74 
 
 
481 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  37.13 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  36.65 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  36.36 
 
 
520 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  37.45 
 
 
473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  36.15 
 
 
468 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  36.08 
 
 
472 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  33.61 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  36.42 
 
 
471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  35.69 
 
 
579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25.64 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.64 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25.64 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25.64 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25.64 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.05 
 
 
482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25.42 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25.42 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  24.43 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.78 
 
 
530 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.57 
 
 
530 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.57 
 
 
530 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  23.82 
 
 
472 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  23.61 
 
 
472 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  27.04 
 
 
472 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  23.33 
 
 
485 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  23.61 
 
 
472 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  27.04 
 
 
472 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.87 
 
 
497 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.67 
 
 
516 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.67 
 
 
516 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.67 
 
 
516 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.02 
 
 
530 aa  93.2  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.67 
 
 
516 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.67 
 
 
516 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.69 
 
 
505 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  21.1 
 
 
508 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.08 
 
 
505 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  22.5 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  21.21 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  24.11 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.38 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  22.38 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.38 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  19.95 
 
 
508 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.18 
 
 
530 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>