More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4442 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  80.98 
 
 		 489 aa  838    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  80.78 
 
 		 489 aa  838    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  80.98 
 
 		 489 aa  836    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  80.98 
 
 		 489 aa  838    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  99.39 
 
 		 489 aa  1011    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  80.37 
 
 		 489 aa  834    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  98.98 
 
 		 489 aa  1008    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  100 
 
 		 489 aa  1019    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  80.78 
 
 		 489 aa  838    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  99.39 
 
 		 489 aa  1011    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  98.98 
 
 		 489 aa  1006    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  80.78 
 
 		 489 aa  838    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  80.78 
 
 		 489 aa  837    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  79.35 
 
 		 489 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  62.35 
 
 		 520 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  62.32 
 
 		 485 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  61.57 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  58.14 
 
 		 496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  57 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  58.14 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  55.97 
 
 		 490 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  78.86 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  42.29 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  43.61 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  38.87 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  42.74 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  40.72 
 
 		 493 aa  340  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  40.04 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  38.11 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  42.53 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  38.34 
 
 		 500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  41.96 
 
 		 497 aa  329  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  43.8 
 
 		 488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  40.89 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.34 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  41.74 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  40.94 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  36.75 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  42.27 
 
 		 472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  41.01 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  39.79 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  39.16 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  40.71 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  35.44 
 
 		 489 aa  299  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.82 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  38.78 
 
 		 477 aa  296  8e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  35.76 
 
 		 474 aa  296  8e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  35.95 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  35.33 
 
 		 476 aa  293  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  38.01 
 
 		 518 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  35.74 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  40.67 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  39.96 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  35.86 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  39.32 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  38.14 
 
 		 506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  38.46 
 
 		 481 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  38.46 
 
 		 481 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  38.46 
 
 		 481 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  37.72 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.42 
 
 		 470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  38.32 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  32.47 
 
 		 485 aa  246  8e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  38.52 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  27.11 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  23.19 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.1 
 
 		 472 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.52 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.52 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.52 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.52 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.52 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  24.54 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.9 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.1 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.52 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.28 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.52 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  21.98 
 
 		 502 aa  87.8  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.15 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  32.82 
 
 		 495 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  25.23 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.43 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.49 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  25.93 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  25.85 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  25.85 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.64 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  25.85 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  25.85 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  25.85 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  25.78 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  25.78 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  23.56 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  24.75 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  24.75 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  25.42 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  25.17 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>