More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2453 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 495 aa  987    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  52.59 
 
 		 516 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  52.74 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  50.21 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  49.38 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  53.55 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  45.83 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  49.89 
 
 		 528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  49.27 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  50.84 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  49.67 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  39.4 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  41.61 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  49.37 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  38.85 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  46.74 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  39.57 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  48.52 
 
 		 523 aa  362  8e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  44.8 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  39.96 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  49.01 
 
 		 499 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  46.87 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  44.59 
 
 		 496 aa  349  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  39.82 
 
 		 467 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  42.06 
 
 		 476 aa  342  7e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  42.06 
 
 		 474 aa  342  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  38.84 
 
 		 473 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  46.93 
 
 		 464 aa  340  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  42.16 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  36.15 
 
 		 485 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  49.68 
 
 		 468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  42.16 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  42.95 
 
 		 490 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  41.95 
 
 		 489 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  37.92 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  44.03 
 
 		 479 aa  333  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  41.95 
 
 		 489 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  41.95 
 
 		 489 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  48.94 
 
 		 502 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  43.95 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  41.74 
 
 		 489 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  42.52 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  42 
 
 		 489 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  42 
 
 		 489 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  41.79 
 
 		 489 aa  326  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  41.79 
 
 		 489 aa  326  7e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  42.25 
 
 		 520 aa  326  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  41.79 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  47.28 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  41.58 
 
 		 489 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  41.58 
 
 		 489 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  42 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  45.7 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  45.7 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  45.7 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  48.35 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  43.47 
 
 		 518 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  41.07 
 
 		 472 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  33.27 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  43.27 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.59 
 
 		 470 aa  262  8.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  37.1 
 
 		 482 aa  227  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  42.48 
 
 		 471 aa  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  44.88 
 
 		 579 aa  180  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  32.03 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  26.72 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  29.77 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  29.77 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.55 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  29.71 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  29.77 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  29.64 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  29.61 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  29.5 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  29.61 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  29.61 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  29.61 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  29.61 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  29.61 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  29.61 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  29.23 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.83 
 
 		 497 aa  97.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.03 
 
 		 492 aa  96.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.03 
 
 		 492 aa  96.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.47 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3131  carbohydrate kinase FGGY  25.16 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25.74 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.46 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.68 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.46 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.46 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.46 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.46 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  21.44 
 
 		 502 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  25.07 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.53 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  22.78 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.23 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  28.53 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.23 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>