More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0499 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  67.49 
 
 		 490 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  100 
 
 		 496 aa  1029    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  93.35 
 
 		 496 aa  951    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  69.36 
 
 		 490 aa  673    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  61.62 
 
 		 520 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  61.72 
 
 		 485 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  58.56 
 
 		 489 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  58.56 
 
 		 489 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  61.29 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  58.35 
 
 		 489 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  58.87 
 
 		 489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  58.14 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  58.35 
 
 		 489 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  57.94 
 
 		 489 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  59.11 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  57.53 
 
 		 489 aa  568  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  57.53 
 
 		 489 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  57.53 
 
 		 489 aa  568  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  59.11 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  57.11 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  57.11 
 
 		 489 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  58.68 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  42.8 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  46.2 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  45.8 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  45.06 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  39.02 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  43.03 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  41.96 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  44.33 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  39.58 
 
 		 476 aa  345  8e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  38.7 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  44.95 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  44.8 
 
 		 495 aa  343  5.999999999999999e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  38.1 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  45.61 
 
 		 488 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  43.86 
 
 		 499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  39.09 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  41.84 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  37.63 
 
 		 476 aa  330  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  37.53 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  41.28 
 
 		 528 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  36.05 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  42.53 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  41.19 
 
 		 523 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  35.86 
 
 		 497 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  35.79 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  41.16 
 
 		 490 aa  309  8e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  41.36 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  42.23 
 
 		 470 aa  302  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  40.49 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  42.08 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  42.06 
 
 		 502 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  40.39 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  38 
 
 		 477 aa  281  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  40.21 
 
 		 473 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.62 
 
 		 470 aa  269  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  38.54 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  38.54 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  38.54 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  37.29 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  39.91 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.6 
 
 		 485 aa  263  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  39.22 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  23.94 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.06 
 
 		 472 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25.06 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25.06 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  25.48 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25.06 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  26.32 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25.06 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  24.81 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  26.57 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  24.81 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  24.81 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  26.32 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  26.07 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  26.32 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  24.67 
 
 		 474 aa  94  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  24.22 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.76 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  23.86 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  24.38 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  25.3 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1031  glycerol kinase  22.39 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00337606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3810  glycerol kinase  23.92 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0347635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.22 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  22.29 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  24.35 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  21.51 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  23.6 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  23.83 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  22.11 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  23.27 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.05 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.66 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  24.8 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  24.21 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  24.66 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>