151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1300 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 482 aa  984    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  38.19 
 
 		 489 aa  302  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  36.08 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  36.08 
 
 		 489 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  35.86 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  35.86 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  35.86 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  35.74 
 
 		 489 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  35.53 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  35.74 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  35.53 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  37.29 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  35.74 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  35.53 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  35.53 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  34.46 
 
 		 493 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  35.53 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  38.53 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  34.18 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  36.29 
 
 		 520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  36.46 
 
 		 490 aa  273  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  33.75 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  35.81 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  36.9 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  36.23 
 
 		 490 aa  267  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  34.93 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  36.97 
 
 		 479 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  35.15 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  32.28 
 
 		 500 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  35.85 
 
 		 497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  32.35 
 
 		 497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  36.86 
 
 		 490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  36.09 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  35.92 
 
 		 485 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  33.76 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  39.1 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  33.75 
 
 		 474 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  33.83 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  37.63 
 
 		 499 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  36.27 
 
 		 516 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  36.73 
 
 		 523 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.15 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  33.69 
 
 		 493 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.48 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  37.37 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  36.82 
 
 		 473 aa  230  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  30.3 
 
 		 485 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  38.51 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  35.83 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  37.84 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  37.1 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  31.18 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  34.39 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  34.54 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  35.12 
 
 		 518 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  29.47 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  38.3 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  36.34 
 
 		 468 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  34.72 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  34.72 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  34.72 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  33.26 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  37.58 
 
 		 471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  37.14 
 
 		 579 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.38 
 
 		 474 aa  90.9  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  20.49 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  24.43 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  23.85 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  23.59 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  24.17 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  23.59 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  22.59 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  24.17 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  23.03 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  23.08 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  23.19 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.32 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  23.33 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  23.01 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  23.22 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  23.37 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  22.85 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  23.37 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  24.43 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  25.66 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  19.88 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3973  carbohydrate kinase FGGY  32.01 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0145215  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  25.55 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  22.79 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  22.84 
 
 		 513 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  27.88 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  25.65 
 
 		 508 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  22.6 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  24.08 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  22.77 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  23.56 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  26.18 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  27.08 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  22.69 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  23.68 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>