More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3788 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  100 
 
 
485 aa  981    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  45.15 
 
 
493 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  45.87 
 
 
467 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  42.8 
 
 
496 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  42.45 
 
 
520 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  40.16 
 
 
497 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  42.39 
 
 
485 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  41.43 
 
 
496 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  39.8 
 
 
490 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  41.84 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  41.84 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  41.84 
 
 
489 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  42.58 
 
 
472 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  41.84 
 
 
489 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  41.35 
 
 
500 aa  362  9e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  41.42 
 
 
489 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  42.29 
 
 
489 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  41.42 
 
 
489 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  41.42 
 
 
489 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  41.46 
 
 
489 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  42.5 
 
 
489 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  41.42 
 
 
489 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  42.71 
 
 
489 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  39.8 
 
 
490 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  42.29 
 
 
489 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  42.58 
 
 
476 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  42.29 
 
 
489 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  38.24 
 
 
477 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  40.37 
 
 
498 aa  348  1e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  38.16 
 
 
516 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  36.94 
 
 
497 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  39.63 
 
 
489 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  37.2 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  39.66 
 
 
473 aa  342  9e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  37.68 
 
 
480 aa  329  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  38.03 
 
 
485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  37.09 
 
 
499 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  36.15 
 
 
495 aa  322  8e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  37 
 
 
472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  37.26 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  34.95 
 
 
479 aa  302  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  37.34 
 
 
474 aa  302  9e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.08 
 
 
528 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  31.93 
 
 
477 aa  285  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  37.15 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  34.27 
 
 
523 aa  282  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  34.32 
 
 
464 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  34.86 
 
 
499 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.74 
 
 
490 aa  279  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  34.84 
 
 
518 aa  277  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  36.17 
 
 
488 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  34.51 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  33.54 
 
 
473 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  36.12 
 
 
499 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  34.24 
 
 
481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  34.24 
 
 
481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  34.24 
 
 
481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  32.64 
 
 
485 aa  254  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  32.98 
 
 
468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.4 
 
 
470 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  41.9 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  32.03 
 
 
506 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  26.84 
 
 
579 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  30.3 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  24.38 
 
 
482 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  24.38 
 
 
472 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  24.38 
 
 
482 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  24.38 
 
 
472 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  24.17 
 
 
482 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  24.17 
 
 
472 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  24.17 
 
 
472 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  24.17 
 
 
472 aa  123  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  22.64 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  22.64 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  23.22 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  24.22 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  24.22 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  25 
 
 
474 aa  113  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  23.81 
 
 
485 aa  113  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.75 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  23.34 
 
 
502 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  21.35 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  21.72 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  24.33 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.66 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.68 
 
 
513 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  21.62 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.49 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.62 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  22.25 
 
 
488 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.59 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  22.78 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  21.61 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.14 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.14 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.14 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.14 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.14 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.68 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  21.28 
 
 
498 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>