More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1830 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  100 
 
 
474 aa  975    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  52.45 
 
 
472 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  52.24 
 
 
472 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  52.45 
 
 
472 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  52.03 
 
 
482 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  52.24 
 
 
472 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  52.03 
 
 
482 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  52.03 
 
 
482 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  52.24 
 
 
472 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  53.21 
 
 
472 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  52.99 
 
 
472 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  52.99 
 
 
472 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  52.99 
 
 
472 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  52.78 
 
 
472 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  44.49 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.11 
 
 
497 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  29.12 
 
 
508 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.46 
 
 
538 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.8 
 
 
508 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.98 
 
 
501 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.18 
 
 
505 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.95 
 
 
499 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  27.23 
 
 
500 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.02 
 
 
500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.69 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.01 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.47 
 
 
528 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.94 
 
 
481 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.78 
 
 
496 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  28.69 
 
 
509 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  28.77 
 
 
499 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  28.99 
 
 
487 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.5 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.07 
 
 
500 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  26.45 
 
 
514 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.77 
 
 
506 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.29 
 
 
509 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  29 
 
 
473 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  29.2 
 
 
496 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.78 
 
 
509 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.85 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  27.05 
 
 
512 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.78 
 
 
518 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  25.7 
 
 
515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.06 
 
 
530 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.56 
 
 
509 aa  134  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  27.67 
 
 
480 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  28.03 
 
 
515 aa  133  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.69 
 
 
498 aa  133  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  23.48 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.74 
 
 
502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.48 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.26 
 
 
504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  28.73 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.28 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.83 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.28 
 
 
530 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  28.09 
 
 
519 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  27.61 
 
 
497 aa  131  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.28 
 
 
530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  26.67 
 
 
501 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  27.54 
 
 
515 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  29.41 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.4 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  27.53 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.47 
 
 
530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.22 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  25.28 
 
 
508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.29 
 
 
524 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  27.58 
 
 
515 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  27.58 
 
 
515 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  27.58 
 
 
515 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.4 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.05 
 
 
520 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  25.27 
 
 
514 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  27.33 
 
 
515 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  24.84 
 
 
483 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  27.05 
 
 
520 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  28.06 
 
 
513 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  25.89 
 
 
482 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.74 
 
 
521 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.36 
 
 
522 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  27.08 
 
 
503 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  26.64 
 
 
512 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  27.04 
 
 
520 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  26.25 
 
 
477 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.82 
 
 
520 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  30.02 
 
 
468 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.57 
 
 
516 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.78 
 
 
516 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.78 
 
 
516 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.78 
 
 
516 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  27.84 
 
 
513 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  28.48 
 
 
472 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  26.67 
 
 
519 aa  123  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>