More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1449 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  100 
 
 
485 aa  1010    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  44.49 
 
 
474 aa  441  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  45.21 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  45.21 
 
 
472 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  45 
 
 
472 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  45 
 
 
482 aa  428  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  45.21 
 
 
472 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  45.21 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  44.35 
 
 
472 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  45 
 
 
472 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  44.12 
 
 
472 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  44.12 
 
 
472 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  44.12 
 
 
472 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  43.7 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  43.91 
 
 
472 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.14 
 
 
505 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  26.04 
 
 
514 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.71 
 
 
497 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.35 
 
 
501 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  27.53 
 
 
487 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.67 
 
 
518 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.25 
 
 
538 aa  150  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  24.45 
 
 
514 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.15 
 
 
520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  24.45 
 
 
508 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.1 
 
 
509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  24.53 
 
 
508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.1 
 
 
505 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.3 
 
 
522 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.9 
 
 
489 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.36 
 
 
520 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.8 
 
 
512 aa  143  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.79 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.9 
 
 
520 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.6 
 
 
500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.58 
 
 
511 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  26.01 
 
 
513 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.7 
 
 
522 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  25.78 
 
 
513 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  25.78 
 
 
513 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  25.49 
 
 
514 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  25.78 
 
 
513 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  25.78 
 
 
513 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  25.78 
 
 
513 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  25.78 
 
 
513 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  25.94 
 
 
520 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  25.97 
 
 
512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.12 
 
 
500 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.16 
 
 
520 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  26.68 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.8 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  24.59 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.8 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.27 
 
 
520 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.22 
 
 
506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.9 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  25.06 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  24.24 
 
 
515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.31 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  24.25 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  26.51 
 
 
497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  24.55 
 
 
508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.48 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  24.35 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  23.9 
 
 
515 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  23.9 
 
 
515 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  23.9 
 
 
515 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.41 
 
 
506 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.44 
 
 
514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  24.55 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.1 
 
 
530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  24.32 
 
 
476 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  24.32 
 
 
476 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  23.47 
 
 
503 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  23.53 
 
 
502 aa  127  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  26.02 
 
 
501 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.5 
 
 
530 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  24.41 
 
 
506 aa  126  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  25.67 
 
 
519 aa  126  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  23.56 
 
 
502 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.74 
 
 
521 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  26.06 
 
 
496 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  26.04 
 
 
496 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  26.2 
 
 
515 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  24.84 
 
 
464 aa  124  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  26.36 
 
 
503 aa  123  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  24.04 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  25.53 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  27.44 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  23.12 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  25.15 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.12 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  25.15 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.08 
 
 
530 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  24.48 
 
 
480 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  23.81 
 
 
479 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.89 
 
 
503 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  25.15 
 
 
496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  25.15 
 
 
496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>