More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0133 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
485 aa  997    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  38.25 
 
 
493 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  34.58 
 
 
493 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  35.54 
 
 
497 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  36.91 
 
 
498 aa  322  7e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  34.17 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  35.07 
 
 
489 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  34.66 
 
 
497 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  37.13 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  32.63 
 
 
516 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  33.81 
 
 
474 aa  297  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  33.81 
 
 
476 aa  296  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  35.33 
 
 
490 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 
495 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  34.75 
 
 
473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 
499 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  32.55 
 
 
467 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.51 
 
 
528 aa  279  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  34.61 
 
 
472 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  33.9 
 
 
490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  32.63 
 
 
479 aa  274  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  31.43 
 
 
523 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  32.13 
 
 
477 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  32.84 
 
 
480 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.33 
 
 
470 aa  264  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  31.6 
 
 
496 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  33.83 
 
 
485 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  34.02 
 
 
489 aa  260  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  31.82 
 
 
488 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  31.88 
 
 
496 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  32.64 
 
 
485 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  31.81 
 
 
485 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  31.66 
 
 
502 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  28.45 
 
 
477 aa  250  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  32.69 
 
 
470 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  32.8 
 
 
489 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  32.67 
 
 
489 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  32.94 
 
 
489 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  32.67 
 
 
489 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  31.6 
 
 
520 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  30.35 
 
 
490 aa  247  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  32.47 
 
 
489 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  31.67 
 
 
489 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  31.67 
 
 
489 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  31.67 
 
 
489 aa  243  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  31.11 
 
 
489 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  30.56 
 
 
464 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  31.11 
 
 
489 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  31.11 
 
 
489 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  31.11 
 
 
489 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  31.11 
 
 
489 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  30.94 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  31 
 
 
473 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  31.78 
 
 
481 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  31.78 
 
 
481 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  31.78 
 
 
481 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  30.49 
 
 
499 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  31.04 
 
 
506 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  29.3 
 
 
468 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  29.47 
 
 
482 aa  217  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  28.81 
 
 
518 aa  207  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  29.35 
 
 
499 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  33.02 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  32.02 
 
 
579 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25.32 
 
 
472 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25.32 
 
 
472 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.32 
 
 
472 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25.11 
 
 
482 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25.11 
 
 
482 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25.11 
 
 
472 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25.11 
 
 
472 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  24.89 
 
 
482 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.57 
 
 
472 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.36 
 
 
472 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25.15 
 
 
472 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.36 
 
 
472 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  25.15 
 
 
472 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.75 
 
 
485 aa  100  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 
505 aa  93.6  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  22.68 
 
 
474 aa  90.1  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  21.77 
 
 
481 aa  87  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  24.95 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  22.03 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  22.03 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  22.31 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  24.68 
 
 
549 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  22.19 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.72 
 
 
518 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.02 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  22.89 
 
 
495 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  21.38 
 
 
495 aa  70.1  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  20.08 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  25.23 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.93 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  25 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  24.25 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  20.72 
 
 
508 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  19.65 
 
 
508 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  21.88 
 
 
489 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>