More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3755 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  99.59 
 
 		 485 aa  999    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  100 
 
 		 472 aa  978    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  100 
 
 		 520 aa  1075    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  65.02 
 
 		 489 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  62.76 
 
 		 489 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  62.76 
 
 		 489 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  62.76 
 
 		 489 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  62.55 
 
 		 489 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  62.55 
 
 		 489 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  62.55 
 
 		 489 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  62.35 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  62.35 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  62.14 
 
 		 489 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  62.14 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  62.14 
 
 		 489 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  62.14 
 
 		 489 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  62.35 
 
 		 489 aa  621  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  59.51 
 
 		 490 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  61.62 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  62.24 
 
 		 496 aa  601  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  59.71 
 
 		 490 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  64.86 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  42.45 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  42.83 
 
 		 477 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  36.81 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  43.19 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  44.33 
 
 		 488 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  40.85 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  42.41 
 
 		 485 aa  329  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  37.63 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  34.98 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  35.81 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  34.71 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  37.42 
 
 		 497 aa  315  9e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  34.36 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  36.36 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  42.25 
 
 		 495 aa  310  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  40.04 
 
 		 479 aa  309  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  33.94 
 
 		 489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  35.61 
 
 		 473 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  39.43 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.82 
 
 		 528 aa  306  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  37.94 
 
 		 516 aa  306  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  39.45 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  41.97 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  42.63 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  39.19 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  36.1 
 
 		 497 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  38.76 
 
 		 518 aa  289  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  37.86 
 
 		 477 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  39.42 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  38.96 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  38.24 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  38.24 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  38.24 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  40 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  39.53 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  36.29 
 
 		 482 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.13 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  39.09 
 
 		 506 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.6 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  39.07 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  38.96 
 
 		 502 aa  246  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  39.2 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  27.15 
 
 		 472 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  27.15 
 
 		 472 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.89 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.89 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.38 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.63 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.09 
 
 		 474 aa  110  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.63 
 
 		 472 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.63 
 
 		 472 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  27.13 
 
 		 482 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  27.08 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  27.08 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  26.82 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  27.13 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  30.97 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  22.81 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  24.72 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  29.21 
 
 		 509 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  20.36 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  19.83 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  23.3 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.94 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.94 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.45 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  23.94 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  23.94 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  23.94 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  21.36 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.78 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  22.44 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  23.19 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.6 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  30.57 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  22.61 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  30.57 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  30.57 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>