More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4476 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
481 aa  948    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
481 aa  948    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
481 aa  948    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  55.27 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  55.89 
 
 
506 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  50.51 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  53.06 
 
 
477 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  53.22 
 
 
502 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  49.48 
 
 
499 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  53.79 
 
 
472 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  45.96 
 
 
493 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  46.78 
 
 
528 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  48.57 
 
 
499 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  45.65 
 
 
477 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  49.69 
 
 
488 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  48.21 
 
 
499 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  47.81 
 
 
464 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  38.36 
 
 
476 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  44.51 
 
 
480 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  39.17 
 
 
489 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  45.19 
 
 
485 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  42.65 
 
 
516 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  51 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  34.52 
 
 
500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  45.7 
 
 
495 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  35.36 
 
 
473 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  46.3 
 
 
473 aa  316  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  43.94 
 
 
518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  37.06 
 
 
498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  42.65 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  41.93 
 
 
479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  35.4 
 
 
493 aa  302  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  40.93 
 
 
490 aa  300  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  38.62 
 
 
489 aa  299  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  38.95 
 
 
485 aa  299  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  41.65 
 
 
490 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  38.66 
 
 
520 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  34.54 
 
 
467 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  39.09 
 
 
489 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  39.09 
 
 
489 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  33.82 
 
 
497 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  40.25 
 
 
496 aa  292  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  38.88 
 
 
489 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  38.88 
 
 
489 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  38.67 
 
 
489 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  38.96 
 
 
496 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  36.4 
 
 
497 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  37.63 
 
 
489 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  37.63 
 
 
489 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  37.63 
 
 
489 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  37.63 
 
 
489 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  37.63 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  34.8 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  37.42 
 
 
489 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  37.63 
 
 
489 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  36.8 
 
 
489 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  34.93 
 
 
474 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  34.72 
 
 
476 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  37.88 
 
 
472 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.72 
 
 
470 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.99 
 
 
485 aa  256  8e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  34.72 
 
 
482 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  46.43 
 
 
579 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  37.89 
 
 
471 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  27.45 
 
 
474 aa  106  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  22.88 
 
 
485 aa  94.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.06 
 
 
482 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  24.83 
 
 
482 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  24.83 
 
 
482 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  26.36 
 
 
472 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  26.59 
 
 
472 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  24.83 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  26.36 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  24.83 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  26.36 
 
 
472 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  24.83 
 
 
472 aa  87  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  24.83 
 
 
472 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  26.36 
 
 
472 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  24.61 
 
 
472 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.14 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  21.56 
 
 
497 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  26.88 
 
 
530 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  26.3 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.88 
 
 
530 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.88 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.2 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.63 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  26.08 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.22 
 
 
516 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.78 
 
 
516 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.78 
 
 
516 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.78 
 
 
516 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.14 
 
 
530 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.95 
 
 
516 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  27.34 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  30.1 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.79 
 
 
530 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  29.8 
 
 
499 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.79 
 
 
530 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  27.22 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>