More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3626 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
506 aa  977    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  55.89 
 
 
481 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  55.89 
 
 
481 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  55.89 
 
 
481 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  53.86 
 
 
523 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  55.08 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  53.03 
 
 
477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  50.55 
 
 
493 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  56.95 
 
 
472 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  51.01 
 
 
488 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  50.33 
 
 
477 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  48.3 
 
 
499 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  46.68 
 
 
528 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  39.14 
 
 
476 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  51.99 
 
 
468 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  47.72 
 
 
480 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  48.09 
 
 
464 aa  359  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  47.37 
 
 
516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  54 
 
 
502 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  50.98 
 
 
499 aa  349  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  37.23 
 
 
473 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  45.28 
 
 
485 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  50.22 
 
 
499 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  48.35 
 
 
495 aa  340  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  37.86 
 
 
493 aa  329  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  38.97 
 
 
489 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  45.87 
 
 
518 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  37.2 
 
 
497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  36.15 
 
 
500 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  47.91 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  47.28 
 
 
490 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  44.05 
 
 
479 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  37.42 
 
 
498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  38.7 
 
 
489 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  38.51 
 
 
489 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  39 
 
 
497 aa  299  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  39.91 
 
 
476 aa  299  8e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  38.51 
 
 
489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  38.51 
 
 
489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  39.78 
 
 
474 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  40.52 
 
 
496 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  38.31 
 
 
489 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.97 
 
 
470 aa  293  6e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  39.61 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  40.79 
 
 
490 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  39.18 
 
 
489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  40.31 
 
 
489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  39.18 
 
 
489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  40.52 
 
 
496 aa  287  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  39.18 
 
 
489 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  39.61 
 
 
485 aa  287  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  39.18 
 
 
489 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  39.18 
 
 
489 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  38.96 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  39.31 
 
 
520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  40 
 
 
489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  41.99 
 
 
490 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  34.3 
 
 
467 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  37.99 
 
 
472 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  32.47 
 
 
485 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.25 
 
 
485 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  34.43 
 
 
482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  47.71 
 
 
579 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  40.06 
 
 
471 aa  203  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  28.79 
 
 
474 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  22.5 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.87 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.11 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.11 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.11 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.11 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.11 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.11 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.86 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3437  carbohydrate kinase FGGY  29.95 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0110073  hitchhiker  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  25.45 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.45 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  22.41 
 
 
500 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  25.19 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.51 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  27.99 
 
 
498 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.93 
 
 
499 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25 
 
 
492 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25 
 
 
492 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  29.86 
 
 
496 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  29.51 
 
 
498 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  28.77 
 
 
493 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  29.86 
 
 
502 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25.58 
 
 
472 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  30.66 
 
 
478 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.32 
 
 
432 aa  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  27.78 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  28.62 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  28.87 
 
 
456 aa  62.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  27.96 
 
 
521 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  27.66 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  29.07 
 
 
508 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  28.22 
 
 
498 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.93 
 
 
548 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.62 
 
 
500 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>