More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0743 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  99.58 
 
 
472 aa  972    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  99.59 
 
 
520 aa  999    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  100 
 
 
485 aa  1003    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  65.01 
 
 
489 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  62.73 
 
 
489 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  62.53 
 
 
489 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  62.73 
 
 
489 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  62.73 
 
 
489 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  62.53 
 
 
489 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  62.94 
 
 
489 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  62.32 
 
 
489 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  62.94 
 
 
489 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  62.73 
 
 
489 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  62.53 
 
 
489 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  62.73 
 
 
489 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  62.53 
 
 
489 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  62.53 
 
 
489 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  61.72 
 
 
496 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  59.5 
 
 
490 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  62.34 
 
 
496 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  59.71 
 
 
490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  65.16 
 
 
471 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  42.39 
 
 
485 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  42.8 
 
 
477 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  36.96 
 
 
493 aa  342  9e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  43.07 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  44.54 
 
 
488 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  41.06 
 
 
493 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  38.01 
 
 
467 aa  326  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  35.05 
 
 
500 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  42.28 
 
 
485 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  34.99 
 
 
474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  36.02 
 
 
498 aa  318  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  34.58 
 
 
476 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  36.65 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  37.4 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  42.52 
 
 
495 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  42.18 
 
 
472 aa  309  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  39.27 
 
 
516 aa  309  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  35.61 
 
 
473 aa  309  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  40.24 
 
 
523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  39.51 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  34.29 
 
 
489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.82 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  39.83 
 
 
479 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  40.3 
 
 
499 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  42.69 
 
 
464 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  35.89 
 
 
497 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  39.08 
 
 
518 aa  289  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  38.08 
 
 
477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  39.64 
 
 
470 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  38.53 
 
 
481 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  39.04 
 
 
499 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  38.53 
 
 
481 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  38.53 
 
 
481 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  39.79 
 
 
499 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  39.83 
 
 
468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  35.81 
 
 
482 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  39.39 
 
 
506 aa  253  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.81 
 
 
485 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.26 
 
 
470 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  39.17 
 
 
502 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  39.1 
 
 
473 aa  247  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  39.7 
 
 
579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.89 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.89 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.63 
 
 
482 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.63 
 
 
482 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.37 
 
 
472 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.37 
 
 
472 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  23.76 
 
 
485 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.37 
 
 
472 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.67 
 
 
482 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  25.85 
 
 
474 aa  107  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  26.56 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.4 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  26.3 
 
 
472 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  26.86 
 
 
472 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  30.53 
 
 
472 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  23.08 
 
 
502 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  25.34 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  20.63 
 
 
500 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  19.83 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  23.38 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  29.35 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.52 
 
 
512 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  22.87 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.91 
 
 
509 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  24.18 
 
 
512 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  24.18 
 
 
511 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  21.93 
 
 
512 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  23.36 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  23.94 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  23.94 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.94 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.94 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  23.94 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  30.13 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.6 
 
 
519 aa  75.1  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  30.13 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>